Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWF9

CCDC83, Coiled-coil domain-containing protein 83, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC83Q8IWF9 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC83Q8IWF9 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC83Q8IWF9 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC83Q8IWF9 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC83Q8IWF9 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC83Q8IWF9 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC83Q8IWF9 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC83Q8IWF9 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC83Q8IWF9 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC83Q8IWF9 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC83Q8IWF9 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC83Q8IWF9 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC83Q8IWF9 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC83Q8IWF9 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC83Q8IWF9 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC83Q8IWF9 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC83Q8IWF9 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC83Q8IWF9 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC83Q8IWF9 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC83Q8IWF9 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC83Q8IWF9 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC83Q8IWF9 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC83Q8IWF9 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC83Q8IWF9 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCDC83Q8IWF9 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCDC83Q8IWF9 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCDC83Q8IWF9 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCDC83Q8IWF9 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCDC83Q8IWF9 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCDC83Q8IWF9 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCDC83Q8IWF9 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCDC83Q8IWF9 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC83Q8IWF9 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC83Q8IWF9 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC83Q8IWF9 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC83Q8IWF9 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC83Q8IWF9 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC83Q8IWF9 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC83Q8IWF9 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC83Q8IWF9 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC83Q8IWF9 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC83Q8IWF9 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC83Q8IWF9 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC83Q8IWF9 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC83Q8IWF9 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC83Q8IWF9 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC83Q8IWF9 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC83Q8IWF9 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC83Q8IWF9 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC83Q8IWF9 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC83Q8IWF9 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC83Q8IWF9 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC83Q8IWF9 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC83Q8IWF9 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC83Q8IWF9 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC83Q8IWF9 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC83Q8IWF9 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC83Q8IWF9 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC83Q8IWF9 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC83Q8IWF9 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC83Q8IWF9 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC83Q8IWF9 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC83Q8IWF9 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC83Q8IWF9 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC83Q8IWF9 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC83Q8IWF9 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC83Q8IWF9 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC83Q8IWF9 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC83Q8IWF9 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC83Q8IWF9 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC83Q8IWF9 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC83Q8IWF9 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC83Q8IWF9 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC83Q8IWF9 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC83Q8IWF9 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC83Q8IWF9 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC83Q8IWF9 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC83Q8IWF9 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC83Q8IWF9 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC83Q8IWF9 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC83Q8IWF9 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC83Q8IWF9 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC83Q8IWF9 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC83Q8IWF9 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC83Q8IWF9 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC83Q8IWF9 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC83Q8IWF9 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC83Q8IWF9 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC83Q8IWF9 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC83Q8IWF9 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC83Q8IWF9 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC83Q8IWF9 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC83Q8IWF9 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC83Q8IWF9 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC83Q8IWF9 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC83Q8IWF9 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC83Q8IWF9 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC83Q8IWF9 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC83Q8IWF9 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC83Q8IWF9 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms