Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVM0

CCDC50, Coiled-coil domain-containing protein 50, humanhuman

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC50Q8IVM0 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC50Q8IVM0 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC50Q8IVM0 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC50Q8IVM0 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC50Q8IVM0 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC50Q8IVM0 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC50Q8IVM0 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC50Q8IVM0 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC50Q8IVM0 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC50Q8IVM0 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC50Q8IVM0 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC50Q8IVM0 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC50Q8IVM0 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC50Q8IVM0 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC50Q8IVM0 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC50Q8IVM0 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC50Q8IVM0 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC50Q8IVM0 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC50Q8IVM0 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC50Q8IVM0 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC50Q8IVM0 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC50Q8IVM0 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC50Q8IVM0 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC50Q8IVM0 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC50Q8IVM0 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC50Q8IVM0 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC50Q8IVM0 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC50Q8IVM0 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC50Q8IVM0 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC50Q8IVM0 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC50Q8IVM0 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC50Q8IVM0 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC50Q8IVM0 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC50Q8IVM0 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC50Q8IVM0 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC50Q8IVM0 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC50Q8IVM0 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC50Q8IVM0 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC50Q8IVM0 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC50Q8IVM0 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC50Q8IVM0 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC50Q8IVM0 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC50Q8IVM0 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC50Q8IVM0 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC50Q8IVM0 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC50Q8IVM0 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC50Q8IVM0 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC50Q8IVM0 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC50Q8IVM0 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC50Q8IVM0 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC50Q8IVM0 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC50Q8IVM0 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC50Q8IVM0 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC50Q8IVM0 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC50Q8IVM0 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC50Q8IVM0 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC50Q8IVM0 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC50Q8IVM0 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC50Q8IVM0 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC50Q8IVM0 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC50Q8IVM0 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC50Q8IVM0 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC50Q8IVM0 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC50Q8IVM0 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC50Q8IVM0 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC50Q8IVM0 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC50Q8IVM0 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC50Q8IVM0 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC50Q8IVM0 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC50Q8IVM0 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC50Q8IVM0 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC50Q8IVM0 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC50Q8IVM0 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC50Q8IVM0 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC50Q8IVM0 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC50Q8IVM0 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC50Q8IVM0 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CCDC50Q8IVM0 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CCDC50Q8IVM0 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CCDC50Q8IVM0 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC50Q8IVM0 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC50Q8IVM0 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC50Q8IVM0 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC50Q8IVM0 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC50Q8IVM0 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC50Q8IVM0 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC50Q8IVM0 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC50Q8IVM0 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC50Q8IVM0 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC50Q8IVM0 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC50Q8IVM0 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC50Q8IVM0 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC50Q8IVM0 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC50Q8IVM0 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC50Q8IVM0 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC50Q8IVM0 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC50Q8IVM0 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC50Q8IVM0 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC50Q8IVM0 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC50Q8IVM0 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms