Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV76

PASD1, Circadian clock protein PASD1, humanhuman

Predictions only

Length 773 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PASD1Q8IV76 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PASD1Q8IV76 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PASD1Q8IV76 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PASD1Q8IV76 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PASD1Q8IV76 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PASD1Q8IV76 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PASD1Q8IV76 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PASD1Q8IV76 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PASD1Q8IV76 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PASD1Q8IV76 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PASD1Q8IV76 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PASD1Q8IV76 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PASD1Q8IV76 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PASD1Q8IV76 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PASD1Q8IV76 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PASD1Q8IV76 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PASD1Q8IV76 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PASD1Q8IV76 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PASD1Q8IV76 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PASD1Q8IV76 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PASD1Q8IV76 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PASD1Q8IV76 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PASD1Q8IV76 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PASD1Q8IV76 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PASD1Q8IV76 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PASD1Q8IV76 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PASD1Q8IV76 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PASD1Q8IV76 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PASD1Q8IV76 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PASD1Q8IV76 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PASD1Q8IV76 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PASD1Q8IV76 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PASD1Q8IV76 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PASD1Q8IV76 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PASD1Q8IV76 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PASD1Q8IV76 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PASD1Q8IV76 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PASD1Q8IV76 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PASD1Q8IV76 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PASD1Q8IV76 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PASD1Q8IV76 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PASD1Q8IV76 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PASD1Q8IV76 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PASD1Q8IV76 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PASD1Q8IV76 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PASD1Q8IV76 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PASD1Q8IV76 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PASD1Q8IV76 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PASD1Q8IV76 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PASD1Q8IV76 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PASD1Q8IV76 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PASD1Q8IV76 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PASD1Q8IV76 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PASD1Q8IV76 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PASD1Q8IV76 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PASD1Q8IV76 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PASD1Q8IV76 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PASD1Q8IV76 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PASD1Q8IV76 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PASD1Q8IV76 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PASD1Q8IV76 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PASD1Q8IV76 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PASD1Q8IV76 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PASD1Q8IV76 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PASD1Q8IV76 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PASD1Q8IV76 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PASD1Q8IV76 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PASD1Q8IV76 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PASD1Q8IV76 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PASD1Q8IV76 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PASD1Q8IV76 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PASD1Q8IV76 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PASD1Q8IV76 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PASD1Q8IV76 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PASD1Q8IV76 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PASD1Q8IV76 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PASD1Q8IV76 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PASD1Q8IV76 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PASD1Q8IV76 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PASD1Q8IV76 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PASD1Q8IV76 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PASD1Q8IV76 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PASD1Q8IV76 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PASD1Q8IV76 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PASD1Q8IV76 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PASD1Q8IV76 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PASD1Q8IV76 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PASD1Q8IV76 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PASD1Q8IV76 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PASD1Q8IV76 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PASD1Q8IV76 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PASD1Q8IV76 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PASD1Q8IV76 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PASD1Q8IV76 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PASD1Q8IV76 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PASD1Q8IV76 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PASD1Q8IV76 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PASD1Q8IV76 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PASD1Q8IV76 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PASD1Q8IV76 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms