Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV35

WDR49, WD repeat-containing protein 49, humanhuman

Predictions only

Length 697 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR49Q8IV35 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
WDR49Q8IV35 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
WDR49Q8IV35 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
WDR49Q8IV35 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
WDR49Q8IV35 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
WDR49Q8IV35 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
WDR49Q8IV35 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
WDR49Q8IV35 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
WDR49Q8IV35 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
WDR49Q8IV35 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
WDR49Q8IV35 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
WDR49Q8IV35 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
WDR49Q8IV35 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
WDR49Q8IV35 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
WDR49Q8IV35 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
WDR49Q8IV35 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
WDR49Q8IV35 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
WDR49Q8IV35 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
WDR49Q8IV35 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
WDR49Q8IV35 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
WDR49Q8IV35 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
WDR49Q8IV35 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
WDR49Q8IV35 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
WDR49Q8IV35 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
WDR49Q8IV35 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
WDR49Q8IV35 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
WDR49Q8IV35 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
WDR49Q8IV35 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
WDR49Q8IV35 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
WDR49Q8IV35 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
WDR49Q8IV35 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
WDR49Q8IV35 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
WDR49Q8IV35 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
WDR49Q8IV35 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
WDR49Q8IV35 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
WDR49Q8IV35 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
WDR49Q8IV35 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
WDR49Q8IV35 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
WDR49Q8IV35 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
WDR49Q8IV35 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
WDR49Q8IV35 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
WDR49Q8IV35 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
WDR49Q8IV35 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
WDR49Q8IV35 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
WDR49Q8IV35 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
WDR49Q8IV35 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
WDR49Q8IV35 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
WDR49Q8IV35 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
WDR49Q8IV35 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
WDR49Q8IV35 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
WDR49Q8IV35 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
WDR49Q8IV35 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
WDR49Q8IV35 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
WDR49Q8IV35 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
WDR49Q8IV35 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
WDR49Q8IV35 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
WDR49Q8IV35 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
WDR49Q8IV35 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
WDR49Q8IV35 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
WDR49Q8IV35 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
WDR49Q8IV35 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
WDR49Q8IV35 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
WDR49Q8IV35 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
WDR49Q8IV35 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
WDR49Q8IV35 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
WDR49Q8IV35 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
WDR49Q8IV35 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
WDR49Q8IV35 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
WDR49Q8IV35 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
WDR49Q8IV35 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
WDR49Q8IV35 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
WDR49Q8IV35 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
WDR49Q8IV35 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
WDR49Q8IV35 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
WDR49Q8IV35 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
WDR49Q8IV35 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
WDR49Q8IV35 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
WDR49Q8IV35 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
WDR49Q8IV35 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
WDR49Q8IV35 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
WDR49Q8IV35 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
WDR49Q8IV35 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
WDR49Q8IV35 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
WDR49Q8IV35 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
WDR49Q8IV35 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
WDR49Q8IV35 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
WDR49Q8IV35 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
WDR49Q8IV35 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
WDR49Q8IV35 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
WDR49Q8IV35 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
WDR49Q8IV35 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
WDR49Q8IV35 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
WDR49Q8IV35 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
WDR49Q8IV35 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
WDR49Q8IV35 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
WDR49Q8IV35 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
WDR49Q8IV35 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
WDR49Q8IV35 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
WDR49Q8IV35 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
WDR49Q8IV35 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms