Protein–RNA interactions for Protein: Q8IU54

IFNL1, Interferon lambda-1, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNL1Q8IU54 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
IFNL1Q8IU54 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
IFNL1Q8IU54 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
IFNL1Q8IU54 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
IFNL1Q8IU54 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
IFNL1Q8IU54 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
IFNL1Q8IU54 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
IFNL1Q8IU54 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
IFNL1Q8IU54 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
IFNL1Q8IU54 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
IFNL1Q8IU54 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
IFNL1Q8IU54 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
IFNL1Q8IU54 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
IFNL1Q8IU54 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
IFNL1Q8IU54 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
IFNL1Q8IU54 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
IFNL1Q8IU54 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
IFNL1Q8IU54 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
IFNL1Q8IU54 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
IFNL1Q8IU54 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
IFNL1Q8IU54 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
IFNL1Q8IU54 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
IFNL1Q8IU54 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
IFNL1Q8IU54 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
IFNL1Q8IU54 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
IFNL1Q8IU54 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
IFNL1Q8IU54 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
IFNL1Q8IU54 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
IFNL1Q8IU54 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
IFNL1Q8IU54 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
IFNL1Q8IU54 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
IFNL1Q8IU54 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
IFNL1Q8IU54 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
IFNL1Q8IU54 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
IFNL1Q8IU54 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
IFNL1Q8IU54 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
IFNL1Q8IU54 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
IFNL1Q8IU54 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
IFNL1Q8IU54 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
IFNL1Q8IU54 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
IFNL1Q8IU54 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
IFNL1Q8IU54 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
IFNL1Q8IU54 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
IFNL1Q8IU54 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
IFNL1Q8IU54 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
IFNL1Q8IU54 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
IFNL1Q8IU54 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
IFNL1Q8IU54 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
IFNL1Q8IU54 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
IFNL1Q8IU54 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
IFNL1Q8IU54 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
IFNL1Q8IU54 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
IFNL1Q8IU54 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
IFNL1Q8IU54 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
IFNL1Q8IU54 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
IFNL1Q8IU54 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
IFNL1Q8IU54 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
IFNL1Q8IU54 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
IFNL1Q8IU54 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
IFNL1Q8IU54 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
IFNL1Q8IU54 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
IFNL1Q8IU54 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
IFNL1Q8IU54 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
IFNL1Q8IU54 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
IFNL1Q8IU54 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
IFNL1Q8IU54 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
IFNL1Q8IU54 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
IFNL1Q8IU54 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
IFNL1Q8IU54 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
IFNL1Q8IU54 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
IFNL1Q8IU54 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
IFNL1Q8IU54 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
IFNL1Q8IU54 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
IFNL1Q8IU54 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
IFNL1Q8IU54 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
IFNL1Q8IU54 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
IFNL1Q8IU54 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
IFNL1Q8IU54 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
IFNL1Q8IU54 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
IFNL1Q8IU54 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
IFNL1Q8IU54 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
IFNL1Q8IU54 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
IFNL1Q8IU54 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
IFNL1Q8IU54 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
IFNL1Q8IU54 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
IFNL1Q8IU54 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
IFNL1Q8IU54 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
IFNL1Q8IU54 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
IFNL1Q8IU54 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
IFNL1Q8IU54 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
IFNL1Q8IU54 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
IFNL1Q8IU54 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
IFNL1Q8IU54 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC24■■□□□ 1.43
IFNL1Q8IU54 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
IFNL1Q8IU54 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC24■■□□□ 1.43
IFNL1Q8IU54 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
IFNL1Q8IU54 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
IFNL1Q8IU54 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
IFNL1Q8IU54 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
IFNL1Q8IU54 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms