Protein–RNA interactions for Protein: Q86WV1

SKAP1, Src kinase-associated phosphoprotein 1, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP1Q86WV1 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SKAP1Q86WV1 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SKAP1Q86WV1 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
SKAP1Q86WV1 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SKAP1Q86WV1 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SKAP1Q86WV1 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SKAP1Q86WV1 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SKAP1Q86WV1 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SKAP1Q86WV1 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SKAP1Q86WV1 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SKAP1Q86WV1 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SKAP1Q86WV1 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
SKAP1Q86WV1 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SKAP1Q86WV1 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SKAP1Q86WV1 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SKAP1Q86WV1 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SKAP1Q86WV1 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SKAP1Q86WV1 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SKAP1Q86WV1 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SKAP1Q86WV1 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SKAP1Q86WV1 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SKAP1Q86WV1 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SKAP1Q86WV1 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SKAP1Q86WV1 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SKAP1Q86WV1 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
SKAP1Q86WV1 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SKAP1Q86WV1 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SKAP1Q86WV1 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
SKAP1Q86WV1 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
SKAP1Q86WV1 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SKAP1Q86WV1 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SKAP1Q86WV1 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SKAP1Q86WV1 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
SKAP1Q86WV1 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SKAP1Q86WV1 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SKAP1Q86WV1 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SKAP1Q86WV1 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SKAP1Q86WV1 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SKAP1Q86WV1 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SKAP1Q86WV1 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SKAP1Q86WV1 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SKAP1Q86WV1 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SKAP1Q86WV1 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SKAP1Q86WV1 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SKAP1Q86WV1 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SKAP1Q86WV1 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SKAP1Q86WV1 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SKAP1Q86WV1 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SKAP1Q86WV1 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SKAP1Q86WV1 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SKAP1Q86WV1 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SKAP1Q86WV1 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SKAP1Q86WV1 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SKAP1Q86WV1 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SKAP1Q86WV1 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SKAP1Q86WV1 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SKAP1Q86WV1 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SKAP1Q86WV1 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SKAP1Q86WV1 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SKAP1Q86WV1 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SKAP1Q86WV1 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SKAP1Q86WV1 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SKAP1Q86WV1 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SKAP1Q86WV1 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SKAP1Q86WV1 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SKAP1Q86WV1 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SKAP1Q86WV1 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
SKAP1Q86WV1 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SKAP1Q86WV1 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SKAP1Q86WV1 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SKAP1Q86WV1 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SKAP1Q86WV1 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SKAP1Q86WV1 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
SKAP1Q86WV1 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SKAP1Q86WV1 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SKAP1Q86WV1 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SKAP1Q86WV1 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SKAP1Q86WV1 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SKAP1Q86WV1 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
SKAP1Q86WV1 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SKAP1Q86WV1 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SKAP1Q86WV1 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SKAP1Q86WV1 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SKAP1Q86WV1 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SKAP1Q86WV1 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SKAP1Q86WV1 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SKAP1Q86WV1 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SKAP1Q86WV1 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SKAP1Q86WV1 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SKAP1Q86WV1 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SKAP1Q86WV1 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
SKAP1Q86WV1 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SKAP1Q86WV1 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SKAP1Q86WV1 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SKAP1Q86WV1 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SKAP1Q86WV1 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SKAP1Q86WV1 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SKAP1Q86WV1 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SKAP1Q86WV1 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SKAP1Q86WV1 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms