Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z739

YTHDF3, YTH domain-containing family protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YTHDF3Q7Z739 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
YTHDF3Q7Z739 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
YTHDF3Q7Z739 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
YTHDF3Q7Z739 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
YTHDF3Q7Z739 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
YTHDF3Q7Z739 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
YTHDF3Q7Z739 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
YTHDF3Q7Z739 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
YTHDF3Q7Z739 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
YTHDF3Q7Z739 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
YTHDF3Q7Z739 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
YTHDF3Q7Z739 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
YTHDF3Q7Z739 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
YTHDF3Q7Z739 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
YTHDF3Q7Z739 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
YTHDF3Q7Z739 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
YTHDF3Q7Z739 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
YTHDF3Q7Z739 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
YTHDF3Q7Z739 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
YTHDF3Q7Z739 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
YTHDF3Q7Z739 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
YTHDF3Q7Z739 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
YTHDF3Q7Z739 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
YTHDF3Q7Z739 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
YTHDF3Q7Z739 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
YTHDF3Q7Z739 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
YTHDF3Q7Z739 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
YTHDF3Q7Z739 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
YTHDF3Q7Z739 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
YTHDF3Q7Z739 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
YTHDF3Q7Z739 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
YTHDF3Q7Z739 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
YTHDF3Q7Z739 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
YTHDF3Q7Z739 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
YTHDF3Q7Z739 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
YTHDF3Q7Z739 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
YTHDF3Q7Z739 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
YTHDF3Q7Z739 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
YTHDF3Q7Z739 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
YTHDF3Q7Z739 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
YTHDF3Q7Z739 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
YTHDF3Q7Z739 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
YTHDF3Q7Z739 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
YTHDF3Q7Z739 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
YTHDF3Q7Z739 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
YTHDF3Q7Z739 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
YTHDF3Q7Z739 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
YTHDF3Q7Z739 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
YTHDF3Q7Z739 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
YTHDF3Q7Z739 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
YTHDF3Q7Z739 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
YTHDF3Q7Z739 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
YTHDF3Q7Z739 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
YTHDF3Q7Z739 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
YTHDF3Q7Z739 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
YTHDF3Q7Z739 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
YTHDF3Q7Z739 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
YTHDF3Q7Z739 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
YTHDF3Q7Z739 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
YTHDF3Q7Z739 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
YTHDF3Q7Z739 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
YTHDF3Q7Z739 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
YTHDF3Q7Z739 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
YTHDF3Q7Z739 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
YTHDF3Q7Z739 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
YTHDF3Q7Z739 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
YTHDF3Q7Z739 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
YTHDF3Q7Z739 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
YTHDF3Q7Z739 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
YTHDF3Q7Z739 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
YTHDF3Q7Z739 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
YTHDF3Q7Z739 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
YTHDF3Q7Z739 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
YTHDF3Q7Z739 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
YTHDF3Q7Z739 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
YTHDF3Q7Z739 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
YTHDF3Q7Z739 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
YTHDF3Q7Z739 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
YTHDF3Q7Z739 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
YTHDF3Q7Z739 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
YTHDF3Q7Z739 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
YTHDF3Q7Z739 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
YTHDF3Q7Z739 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
YTHDF3Q7Z739 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
YTHDF3Q7Z739 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
YTHDF3Q7Z739 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
YTHDF3Q7Z739 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
YTHDF3Q7Z739 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
YTHDF3Q7Z739 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
YTHDF3Q7Z739 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
YTHDF3Q7Z739 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
YTHDF3Q7Z739 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
YTHDF3Q7Z739 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
YTHDF3Q7Z739 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
YTHDF3Q7Z739 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
YTHDF3Q7Z739 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
YTHDF3Q7Z739 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
YTHDF3Q7Z739 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
YTHDF3Q7Z739 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
YTHDF3Q7Z739 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms