Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3Y8

KRT27, Keratin, type I cytoskeletal 27, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT27Q7Z3Y8 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
KRT27Q7Z3Y8 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
KRT27Q7Z3Y8 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
KRT27Q7Z3Y8 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
KRT27Q7Z3Y8 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
KRT27Q7Z3Y8 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
KRT27Q7Z3Y8 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
KRT27Q7Z3Y8 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
KRT27Q7Z3Y8 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
KRT27Q7Z3Y8 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
KRT27Q7Z3Y8 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
KRT27Q7Z3Y8 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
KRT27Q7Z3Y8 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
KRT27Q7Z3Y8 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
KRT27Q7Z3Y8 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
KRT27Q7Z3Y8 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
KRT27Q7Z3Y8 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
KRT27Q7Z3Y8 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
KRT27Q7Z3Y8 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
KRT27Q7Z3Y8 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
KRT27Q7Z3Y8 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
KRT27Q7Z3Y8 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
KRT27Q7Z3Y8 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
KRT27Q7Z3Y8 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
KRT27Q7Z3Y8 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
KRT27Q7Z3Y8 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
KRT27Q7Z3Y8 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
KRT27Q7Z3Y8 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
KRT27Q7Z3Y8 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
KRT27Q7Z3Y8 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
KRT27Q7Z3Y8 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
KRT27Q7Z3Y8 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
KRT27Q7Z3Y8 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
KRT27Q7Z3Y8 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
KRT27Q7Z3Y8 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.96
KRT27Q7Z3Y8 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
KRT27Q7Z3Y8 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
KRT27Q7Z3Y8 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
KRT27Q7Z3Y8 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
KRT27Q7Z3Y8 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
KRT27Q7Z3Y8 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
KRT27Q7Z3Y8 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
KRT27Q7Z3Y8 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
KRT27Q7Z3Y8 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
KRT27Q7Z3Y8 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
KRT27Q7Z3Y8 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
KRT27Q7Z3Y8 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
KRT27Q7Z3Y8 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
KRT27Q7Z3Y8 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
KRT27Q7Z3Y8 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
KRT27Q7Z3Y8 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
KRT27Q7Z3Y8 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
KRT27Q7Z3Y8 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC27.31■■□□□ 1.96
KRT27Q7Z3Y8 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
KRT27Q7Z3Y8 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
KRT27Q7Z3Y8 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
KRT27Q7Z3Y8 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
KRT27Q7Z3Y8 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
KRT27Q7Z3Y8 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
KRT27Q7Z3Y8 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
KRT27Q7Z3Y8 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
KRT27Q7Z3Y8 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
KRT27Q7Z3Y8 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
KRT27Q7Z3Y8 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
KRT27Q7Z3Y8 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
KRT27Q7Z3Y8 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
KRT27Q7Z3Y8 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
KRT27Q7Z3Y8 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
KRT27Q7Z3Y8 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
KRT27Q7Z3Y8 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
KRT27Q7Z3Y8 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
KRT27Q7Z3Y8 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
KRT27Q7Z3Y8 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
KRT27Q7Z3Y8 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
KRT27Q7Z3Y8 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
KRT27Q7Z3Y8 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
KRT27Q7Z3Y8 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
KRT27Q7Z3Y8 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
KRT27Q7Z3Y8 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
KRT27Q7Z3Y8 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
KRT27Q7Z3Y8 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
KRT27Q7Z3Y8 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
KRT27Q7Z3Y8 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
KRT27Q7Z3Y8 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
KRT27Q7Z3Y8 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
KRT27Q7Z3Y8 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
KRT27Q7Z3Y8 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
KRT27Q7Z3Y8 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
KRT27Q7Z3Y8 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
KRT27Q7Z3Y8 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
KRT27Q7Z3Y8 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
KRT27Q7Z3Y8 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
KRT27Q7Z3Y8 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
KRT27Q7Z3Y8 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
KRT27Q7Z3Y8 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
KRT27Q7Z3Y8 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
KRT27Q7Z3Y8 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
KRT27Q7Z3Y8 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
KRT27Q7Z3Y8 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
KRT27Q7Z3Y8 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms