Protein–RNA interactions for Protein: Q7LGA3

HS2ST1, Heparan sulfate 2-O-sulfotransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HS2ST1Q7LGA3 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
HS2ST1Q7LGA3 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HS2ST1Q7LGA3 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
HS2ST1Q7LGA3 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HS2ST1Q7LGA3 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HS2ST1Q7LGA3 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HS2ST1Q7LGA3 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HS2ST1Q7LGA3 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HS2ST1Q7LGA3 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HS2ST1Q7LGA3 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HS2ST1Q7LGA3 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HS2ST1Q7LGA3 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
HS2ST1Q7LGA3 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HS2ST1Q7LGA3 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
HS2ST1Q7LGA3 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
HS2ST1Q7LGA3 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HS2ST1Q7LGA3 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HS2ST1Q7LGA3 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HS2ST1Q7LGA3 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HS2ST1Q7LGA3 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HS2ST1Q7LGA3 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HS2ST1Q7LGA3 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HS2ST1Q7LGA3 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HS2ST1Q7LGA3 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HS2ST1Q7LGA3 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HS2ST1Q7LGA3 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HS2ST1Q7LGA3 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HS2ST1Q7LGA3 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HS2ST1Q7LGA3 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HS2ST1Q7LGA3 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HS2ST1Q7LGA3 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HS2ST1Q7LGA3 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HS2ST1Q7LGA3 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HS2ST1Q7LGA3 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HS2ST1Q7LGA3 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HS2ST1Q7LGA3 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HS2ST1Q7LGA3 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HS2ST1Q7LGA3 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HS2ST1Q7LGA3 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HS2ST1Q7LGA3 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
HS2ST1Q7LGA3 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HS2ST1Q7LGA3 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HS2ST1Q7LGA3 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HS2ST1Q7LGA3 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HS2ST1Q7LGA3 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HS2ST1Q7LGA3 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HS2ST1Q7LGA3 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HS2ST1Q7LGA3 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HS2ST1Q7LGA3 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HS2ST1Q7LGA3 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HS2ST1Q7LGA3 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HS2ST1Q7LGA3 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HS2ST1Q7LGA3 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HS2ST1Q7LGA3 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HS2ST1Q7LGA3 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HS2ST1Q7LGA3 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HS2ST1Q7LGA3 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HS2ST1Q7LGA3 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HS2ST1Q7LGA3 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HS2ST1Q7LGA3 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HS2ST1Q7LGA3 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HS2ST1Q7LGA3 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HS2ST1Q7LGA3 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HS2ST1Q7LGA3 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HS2ST1Q7LGA3 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HS2ST1Q7LGA3 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HS2ST1Q7LGA3 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HS2ST1Q7LGA3 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HS2ST1Q7LGA3 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HS2ST1Q7LGA3 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HS2ST1Q7LGA3 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HS2ST1Q7LGA3 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HS2ST1Q7LGA3 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HS2ST1Q7LGA3 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
HS2ST1Q7LGA3 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
HS2ST1Q7LGA3 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HS2ST1Q7LGA3 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HS2ST1Q7LGA3 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HS2ST1Q7LGA3 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HS2ST1Q7LGA3 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HS2ST1Q7LGA3 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
HS2ST1Q7LGA3 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HS2ST1Q7LGA3 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HS2ST1Q7LGA3 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HS2ST1Q7LGA3 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HS2ST1Q7LGA3 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HS2ST1Q7LGA3 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
HS2ST1Q7LGA3 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HS2ST1Q7LGA3 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
HS2ST1Q7LGA3 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HS2ST1Q7LGA3 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HS2ST1Q7LGA3 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HS2ST1Q7LGA3 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HS2ST1Q7LGA3 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HS2ST1Q7LGA3 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HS2ST1Q7LGA3 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HS2ST1Q7LGA3 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HS2ST1Q7LGA3 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HS2ST1Q7LGA3 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HS2ST1Q7LGA3 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms