Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZV73

FGD6, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,430 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD6Q6ZV73 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
FGD6Q6ZV73 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
FGD6Q6ZV73 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
FGD6Q6ZV73 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.64■■■□□ 2.66
FGD6Q6ZV73 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC31.64■■■□□ 2.66
FGD6Q6ZV73 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
FGD6Q6ZV73 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
FGD6Q6ZV73 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC31.64■■■□□ 2.66
FGD6Q6ZV73 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
FGD6Q6ZV73 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC31.64■■■□□ 2.66
FGD6Q6ZV73 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC31.64■■■□□ 2.66
FGD6Q6ZV73 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
FGD6Q6ZV73 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC31.64■■■□□ 2.66
FGD6Q6ZV73 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC31.64■■■□□ 2.65
FGD6Q6ZV73 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.65
FGD6Q6ZV73 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.65
FGD6Q6ZV73 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
FGD6Q6ZV73 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC31.63■■■□□ 2.65
FGD6Q6ZV73 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC31.63■■■□□ 2.65
FGD6Q6ZV73 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC31.63■■■□□ 2.65
FGD6Q6ZV73 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
FGD6Q6ZV73 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
FGD6Q6ZV73 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC31.63■■■□□ 2.65
FGD6Q6ZV73 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.65
FGD6Q6ZV73 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
FGD6Q6ZV73 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.65
FGD6Q6ZV73 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
FGD6Q6ZV73 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
FGD6Q6ZV73 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC31.62■■■□□ 2.65
FGD6Q6ZV73 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
FGD6Q6ZV73 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC31.62■■■□□ 2.65
FGD6Q6ZV73 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC31.62■■■□□ 2.65
FGD6Q6ZV73 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC31.62■■■□□ 2.65
FGD6Q6ZV73 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC31.62■■■□□ 2.65
FGD6Q6ZV73 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
FGD6Q6ZV73 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
FGD6Q6ZV73 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
FGD6Q6ZV73 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC31.62■■■□□ 2.65
FGD6Q6ZV73 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
FGD6Q6ZV73 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
FGD6Q6ZV73 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
FGD6Q6ZV73 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC31.61■■■□□ 2.65
FGD6Q6ZV73 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.61■■■□□ 2.65
FGD6Q6ZV73 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC31.61■■■□□ 2.65
FGD6Q6ZV73 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
FGD6Q6ZV73 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
FGD6Q6ZV73 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
FGD6Q6ZV73 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
FGD6Q6ZV73 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
FGD6Q6ZV73 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
FGD6Q6ZV73 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC31.6■■■□□ 2.65
FGD6Q6ZV73 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
FGD6Q6ZV73 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
FGD6Q6ZV73 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC31.6■■■□□ 2.65
FGD6Q6ZV73 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC31.6■■■□□ 2.65
FGD6Q6ZV73 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC31.6■■■□□ 2.65
FGD6Q6ZV73 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC31.6■■■□□ 2.65
FGD6Q6ZV73 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
FGD6Q6ZV73 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC31.6■■■□□ 2.65
FGD6Q6ZV73 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
FGD6Q6ZV73 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC31.59■■■□□ 2.65
FGD6Q6ZV73 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
FGD6Q6ZV73 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
FGD6Q6ZV73 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC31.59■■■□□ 2.65
FGD6Q6ZV73 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC31.59■■■□□ 2.65
FGD6Q6ZV73 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC31.59■■■□□ 2.65
FGD6Q6ZV73 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC31.59■■■□□ 2.65
FGD6Q6ZV73 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
FGD6Q6ZV73 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
FGD6Q6ZV73 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
FGD6Q6ZV73 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
FGD6Q6ZV73 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
FGD6Q6ZV73 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
FGD6Q6ZV73 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
FGD6Q6ZV73 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC31.59■■■□□ 2.65
FGD6Q6ZV73 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
FGD6Q6ZV73 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
FGD6Q6ZV73 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC31.58■■■□□ 2.65
FGD6Q6ZV73 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
FGD6Q6ZV73 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
FGD6Q6ZV73 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
FGD6Q6ZV73 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
FGD6Q6ZV73 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC31.58■■■□□ 2.65
FGD6Q6ZV73 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
FGD6Q6ZV73 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
FGD6Q6ZV73 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC31.58■■■□□ 2.65
FGD6Q6ZV73 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC31.58■■■□□ 2.65
FGD6Q6ZV73 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC31.58■■■□□ 2.65
FGD6Q6ZV73 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
FGD6Q6ZV73 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.64
FGD6Q6ZV73 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
FGD6Q6ZV73 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
FGD6Q6ZV73 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.64
FGD6Q6ZV73 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.64
FGD6Q6ZV73 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
FGD6Q6ZV73 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
FGD6Q6ZV73 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC31.57■■■□□ 2.64
FGD6Q6ZV73 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC31.57■■■□□ 2.64
FGD6Q6ZV73 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.64
FGD6Q6ZV73 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms