Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZR52

ZNF493, Zinc finger protein 493, humanhuman

Predictions only

Length 646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF493Q6ZR52 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF493Q6ZR52 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF493Q6ZR52 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF493Q6ZR52 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF493Q6ZR52 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF493Q6ZR52 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF493Q6ZR52 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF493Q6ZR52 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF493Q6ZR52 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF493Q6ZR52 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF493Q6ZR52 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF493Q6ZR52 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF493Q6ZR52 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF493Q6ZR52 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF493Q6ZR52 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF493Q6ZR52 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF493Q6ZR52 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF493Q6ZR52 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF493Q6ZR52 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF493Q6ZR52 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF493Q6ZR52 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF493Q6ZR52 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF493Q6ZR52 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF493Q6ZR52 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF493Q6ZR52 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF493Q6ZR52 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF493Q6ZR52 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF493Q6ZR52 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF493Q6ZR52 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF493Q6ZR52 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF493Q6ZR52 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF493Q6ZR52 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF493Q6ZR52 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF493Q6ZR52 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF493Q6ZR52 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF493Q6ZR52 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF493Q6ZR52 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF493Q6ZR52 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF493Q6ZR52 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF493Q6ZR52 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF493Q6ZR52 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF493Q6ZR52 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF493Q6ZR52 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF493Q6ZR52 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF493Q6ZR52 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF493Q6ZR52 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF493Q6ZR52 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF493Q6ZR52 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF493Q6ZR52 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF493Q6ZR52 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF493Q6ZR52 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF493Q6ZR52 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF493Q6ZR52 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNF493Q6ZR52 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNF493Q6ZR52 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNF493Q6ZR52 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNF493Q6ZR52 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNF493Q6ZR52 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNF493Q6ZR52 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNF493Q6ZR52 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNF493Q6ZR52 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNF493Q6ZR52 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNF493Q6ZR52 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNF493Q6ZR52 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNF493Q6ZR52 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNF493Q6ZR52 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNF493Q6ZR52 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNF493Q6ZR52 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNF493Q6ZR52 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNF493Q6ZR52 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNF493Q6ZR52 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNF493Q6ZR52 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNF493Q6ZR52 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNF493Q6ZR52 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNF493Q6ZR52 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNF493Q6ZR52 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ZNF493Q6ZR52 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ZNF493Q6ZR52 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ZNF493Q6ZR52 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
ZNF493Q6ZR52 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ZNF493Q6ZR52 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ZNF493Q6ZR52 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ZNF493Q6ZR52 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ZNF493Q6ZR52 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ZNF493Q6ZR52 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ZNF493Q6ZR52 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ZNF493Q6ZR52 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ZNF493Q6ZR52 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF493Q6ZR52 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF493Q6ZR52 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF493Q6ZR52 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF493Q6ZR52 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF493Q6ZR52 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF493Q6ZR52 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF493Q6ZR52 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF493Q6ZR52 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF493Q6ZR52 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF493Q6ZR52 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF493Q6ZR52 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF493Q6ZR52 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms