Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZN66

GBP6, Guanylate-binding protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 633 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP6Q6ZN66 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GBP6Q6ZN66 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GBP6Q6ZN66 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GBP6Q6ZN66 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GBP6Q6ZN66 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GBP6Q6ZN66 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GBP6Q6ZN66 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GBP6Q6ZN66 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GBP6Q6ZN66 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GBP6Q6ZN66 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GBP6Q6ZN66 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GBP6Q6ZN66 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GBP6Q6ZN66 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GBP6Q6ZN66 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GBP6Q6ZN66 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GBP6Q6ZN66 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GBP6Q6ZN66 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GBP6Q6ZN66 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GBP6Q6ZN66 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GBP6Q6ZN66 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GBP6Q6ZN66 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GBP6Q6ZN66 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GBP6Q6ZN66 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
GBP6Q6ZN66 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GBP6Q6ZN66 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GBP6Q6ZN66 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GBP6Q6ZN66 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GBP6Q6ZN66 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
GBP6Q6ZN66 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GBP6Q6ZN66 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GBP6Q6ZN66 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GBP6Q6ZN66 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GBP6Q6ZN66 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GBP6Q6ZN66 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GBP6Q6ZN66 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
GBP6Q6ZN66 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GBP6Q6ZN66 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GBP6Q6ZN66 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GBP6Q6ZN66 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GBP6Q6ZN66 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GBP6Q6ZN66 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GBP6Q6ZN66 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GBP6Q6ZN66 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
GBP6Q6ZN66 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GBP6Q6ZN66 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GBP6Q6ZN66 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GBP6Q6ZN66 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GBP6Q6ZN66 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GBP6Q6ZN66 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GBP6Q6ZN66 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GBP6Q6ZN66 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GBP6Q6ZN66 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
GBP6Q6ZN66 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GBP6Q6ZN66 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
GBP6Q6ZN66 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GBP6Q6ZN66 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GBP6Q6ZN66 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GBP6Q6ZN66 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GBP6Q6ZN66 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
GBP6Q6ZN66 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
GBP6Q6ZN66 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
GBP6Q6ZN66 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
GBP6Q6ZN66 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GBP6Q6ZN66 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GBP6Q6ZN66 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GBP6Q6ZN66 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GBP6Q6ZN66 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GBP6Q6ZN66 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GBP6Q6ZN66 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GBP6Q6ZN66 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GBP6Q6ZN66 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GBP6Q6ZN66 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GBP6Q6ZN66 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
GBP6Q6ZN66 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GBP6Q6ZN66 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GBP6Q6ZN66 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GBP6Q6ZN66 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GBP6Q6ZN66 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GBP6Q6ZN66 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GBP6Q6ZN66 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GBP6Q6ZN66 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GBP6Q6ZN66 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GBP6Q6ZN66 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GBP6Q6ZN66 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GBP6Q6ZN66 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GBP6Q6ZN66 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GBP6Q6ZN66 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GBP6Q6ZN66 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GBP6Q6ZN66 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GBP6Q6ZN66 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GBP6Q6ZN66 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GBP6Q6ZN66 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GBP6Q6ZN66 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GBP6Q6ZN66 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GBP6Q6ZN66 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GBP6Q6ZN66 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GBP6Q6ZN66 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GBP6Q6ZN66 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GBP6Q6ZN66 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GBP6Q6ZN66 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms