Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWL2

SUSD1, Sushi domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD1Q6UWL2 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SUSD1Q6UWL2 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SUSD1Q6UWL2 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SUSD1Q6UWL2 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
SUSD1Q6UWL2 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SUSD1Q6UWL2 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SUSD1Q6UWL2 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SUSD1Q6UWL2 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SUSD1Q6UWL2 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SUSD1Q6UWL2 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SUSD1Q6UWL2 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SUSD1Q6UWL2 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SUSD1Q6UWL2 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SUSD1Q6UWL2 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SUSD1Q6UWL2 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SUSD1Q6UWL2 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SUSD1Q6UWL2 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SUSD1Q6UWL2 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SUSD1Q6UWL2 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SUSD1Q6UWL2 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SUSD1Q6UWL2 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SUSD1Q6UWL2 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SUSD1Q6UWL2 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SUSD1Q6UWL2 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SUSD1Q6UWL2 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
SUSD1Q6UWL2 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SUSD1Q6UWL2 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
SUSD1Q6UWL2 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SUSD1Q6UWL2 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SUSD1Q6UWL2 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SUSD1Q6UWL2 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SUSD1Q6UWL2 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SUSD1Q6UWL2 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SUSD1Q6UWL2 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SUSD1Q6UWL2 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SUSD1Q6UWL2 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SUSD1Q6UWL2 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SUSD1Q6UWL2 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SUSD1Q6UWL2 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SUSD1Q6UWL2 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SUSD1Q6UWL2 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SUSD1Q6UWL2 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SUSD1Q6UWL2 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SUSD1Q6UWL2 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
SUSD1Q6UWL2 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SUSD1Q6UWL2 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
SUSD1Q6UWL2 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SUSD1Q6UWL2 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SUSD1Q6UWL2 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SUSD1Q6UWL2 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SUSD1Q6UWL2 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SUSD1Q6UWL2 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SUSD1Q6UWL2 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SUSD1Q6UWL2 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SUSD1Q6UWL2 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SUSD1Q6UWL2 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SUSD1Q6UWL2 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SUSD1Q6UWL2 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SUSD1Q6UWL2 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SUSD1Q6UWL2 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SUSD1Q6UWL2 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SUSD1Q6UWL2 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SUSD1Q6UWL2 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SUSD1Q6UWL2 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SUSD1Q6UWL2 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SUSD1Q6UWL2 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SUSD1Q6UWL2 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SUSD1Q6UWL2 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SUSD1Q6UWL2 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SUSD1Q6UWL2 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SUSD1Q6UWL2 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SUSD1Q6UWL2 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SUSD1Q6UWL2 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SUSD1Q6UWL2 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SUSD1Q6UWL2 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SUSD1Q6UWL2 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
SUSD1Q6UWL2 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SUSD1Q6UWL2 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SUSD1Q6UWL2 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SUSD1Q6UWL2 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SUSD1Q6UWL2 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SUSD1Q6UWL2 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SUSD1Q6UWL2 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SUSD1Q6UWL2 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SUSD1Q6UWL2 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SUSD1Q6UWL2 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SUSD1Q6UWL2 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SUSD1Q6UWL2 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SUSD1Q6UWL2 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SUSD1Q6UWL2 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SUSD1Q6UWL2 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SUSD1Q6UWL2 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SUSD1Q6UWL2 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SUSD1Q6UWL2 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SUSD1Q6UWL2 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SUSD1Q6UWL2 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SUSD1Q6UWL2 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SUSD1Q6UWL2 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SUSD1Q6UWL2 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SUSD1Q6UWL2 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms