Protein–RNA interactions for Protein: Q6TDU7

CASC1, Protein CASC1, humanhuman

Predictions only

Length 716 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASC1Q6TDU7 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CASC1Q6TDU7 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CASC1Q6TDU7 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CASC1Q6TDU7 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CASC1Q6TDU7 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CASC1Q6TDU7 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CASC1Q6TDU7 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CASC1Q6TDU7 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CASC1Q6TDU7 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CASC1Q6TDU7 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CASC1Q6TDU7 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CASC1Q6TDU7 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CASC1Q6TDU7 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CASC1Q6TDU7 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CASC1Q6TDU7 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CASC1Q6TDU7 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CASC1Q6TDU7 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CASC1Q6TDU7 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CASC1Q6TDU7 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CASC1Q6TDU7 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CASC1Q6TDU7 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CASC1Q6TDU7 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CASC1Q6TDU7 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CASC1Q6TDU7 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CASC1Q6TDU7 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CASC1Q6TDU7 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CASC1Q6TDU7 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CASC1Q6TDU7 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CASC1Q6TDU7 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CASC1Q6TDU7 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CASC1Q6TDU7 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CASC1Q6TDU7 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CASC1Q6TDU7 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CASC1Q6TDU7 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CASC1Q6TDU7 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CASC1Q6TDU7 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CASC1Q6TDU7 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CASC1Q6TDU7 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CASC1Q6TDU7 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CASC1Q6TDU7 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CASC1Q6TDU7 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CASC1Q6TDU7 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CASC1Q6TDU7 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CASC1Q6TDU7 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
CASC1Q6TDU7 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CASC1Q6TDU7 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CASC1Q6TDU7 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CASC1Q6TDU7 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CASC1Q6TDU7 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CASC1Q6TDU7 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CASC1Q6TDU7 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CASC1Q6TDU7 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CASC1Q6TDU7 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CASC1Q6TDU7 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CASC1Q6TDU7 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CASC1Q6TDU7 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
CASC1Q6TDU7 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC25.33■■□□□ 1.64
CASC1Q6TDU7 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CASC1Q6TDU7 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CASC1Q6TDU7 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CASC1Q6TDU7 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CASC1Q6TDU7 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CASC1Q6TDU7 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CASC1Q6TDU7 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CASC1Q6TDU7 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CASC1Q6TDU7 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CASC1Q6TDU7 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CASC1Q6TDU7 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CASC1Q6TDU7 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CASC1Q6TDU7 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CASC1Q6TDU7 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CASC1Q6TDU7 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CASC1Q6TDU7 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CASC1Q6TDU7 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CASC1Q6TDU7 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CASC1Q6TDU7 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CASC1Q6TDU7 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CASC1Q6TDU7 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CASC1Q6TDU7 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CASC1Q6TDU7 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CASC1Q6TDU7 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CASC1Q6TDU7 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CASC1Q6TDU7 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CASC1Q6TDU7 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CASC1Q6TDU7 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CASC1Q6TDU7 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CASC1Q6TDU7 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CASC1Q6TDU7 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CASC1Q6TDU7 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CASC1Q6TDU7 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CASC1Q6TDU7 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CASC1Q6TDU7 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CASC1Q6TDU7 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CASC1Q6TDU7 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CASC1Q6TDU7 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CASC1Q6TDU7 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CASC1Q6TDU7 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CASC1Q6TDU7 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CASC1Q6TDU7 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CASC1Q6TDU7 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms