Protein–RNA interactions for Protein: Q6SA08

TSSK4, Testis-specific serine/threonine-protein kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSSK4Q6SA08 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TSSK4Q6SA08 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TSSK4Q6SA08 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TSSK4Q6SA08 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TSSK4Q6SA08 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TSSK4Q6SA08 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TSSK4Q6SA08 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TSSK4Q6SA08 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TSSK4Q6SA08 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TSSK4Q6SA08 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TSSK4Q6SA08 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TSSK4Q6SA08 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TSSK4Q6SA08 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TSSK4Q6SA08 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
TSSK4Q6SA08 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TSSK4Q6SA08 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TSSK4Q6SA08 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TSSK4Q6SA08 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TSSK4Q6SA08 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TSSK4Q6SA08 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TSSK4Q6SA08 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TSSK4Q6SA08 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TSSK4Q6SA08 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TSSK4Q6SA08 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TSSK4Q6SA08 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TSSK4Q6SA08 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TSSK4Q6SA08 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TSSK4Q6SA08 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
TSSK4Q6SA08 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TSSK4Q6SA08 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TSSK4Q6SA08 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TSSK4Q6SA08 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TSSK4Q6SA08 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TSSK4Q6SA08 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TSSK4Q6SA08 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TSSK4Q6SA08 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TSSK4Q6SA08 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TSSK4Q6SA08 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TSSK4Q6SA08 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TSSK4Q6SA08 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TSSK4Q6SA08 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TSSK4Q6SA08 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TSSK4Q6SA08 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TSSK4Q6SA08 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TSSK4Q6SA08 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TSSK4Q6SA08 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TSSK4Q6SA08 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TSSK4Q6SA08 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TSSK4Q6SA08 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TSSK4Q6SA08 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TSSK4Q6SA08 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
TSSK4Q6SA08 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TSSK4Q6SA08 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TSSK4Q6SA08 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TSSK4Q6SA08 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TSSK4Q6SA08 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TSSK4Q6SA08 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TSSK4Q6SA08 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TSSK4Q6SA08 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TSSK4Q6SA08 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TSSK4Q6SA08 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TSSK4Q6SA08 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TSSK4Q6SA08 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TSSK4Q6SA08 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TSSK4Q6SA08 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TSSK4Q6SA08 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TSSK4Q6SA08 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TSSK4Q6SA08 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TSSK4Q6SA08 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TSSK4Q6SA08 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TSSK4Q6SA08 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TSSK4Q6SA08 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TSSK4Q6SA08 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TSSK4Q6SA08 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TSSK4Q6SA08 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TSSK4Q6SA08 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TSSK4Q6SA08 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TSSK4Q6SA08 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TSSK4Q6SA08 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TSSK4Q6SA08 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TSSK4Q6SA08 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TSSK4Q6SA08 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TSSK4Q6SA08 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
TSSK4Q6SA08 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TSSK4Q6SA08 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TSSK4Q6SA08 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TSSK4Q6SA08 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TSSK4Q6SA08 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TSSK4Q6SA08 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
TSSK4Q6SA08 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TSSK4Q6SA08 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TSSK4Q6SA08 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TSSK4Q6SA08 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TSSK4Q6SA08 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TSSK4Q6SA08 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TSSK4Q6SA08 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TSSK4Q6SA08 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TSSK4Q6SA08 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TSSK4Q6SA08 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TSSK4Q6SA08 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms