Protein–RNA interactions for Protein: Q6PK04

CCDC137, Coiled-coil domain-containing protein 137, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC137Q6PK04 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC137Q6PK04 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC137Q6PK04 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC137Q6PK04 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC137Q6PK04 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC137Q6PK04 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC137Q6PK04 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC137Q6PK04 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC137Q6PK04 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC137Q6PK04 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC137Q6PK04 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC137Q6PK04 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC137Q6PK04 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC137Q6PK04 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC137Q6PK04 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC137Q6PK04 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC137Q6PK04 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC137Q6PK04 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC137Q6PK04 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC137Q6PK04 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC137Q6PK04 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC137Q6PK04 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC137Q6PK04 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC137Q6PK04 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC137Q6PK04 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC137Q6PK04 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC137Q6PK04 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC137Q6PK04 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC137Q6PK04 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CCDC137Q6PK04 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CCDC137Q6PK04 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
CCDC137Q6PK04 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
CCDC137Q6PK04 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC137Q6PK04 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC137Q6PK04 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC137Q6PK04 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC137Q6PK04 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC137Q6PK04 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC137Q6PK04 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC137Q6PK04 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC137Q6PK04 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC137Q6PK04 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC137Q6PK04 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC137Q6PK04 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC137Q6PK04 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC137Q6PK04 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC137Q6PK04 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC137Q6PK04 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC137Q6PK04 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC137Q6PK04 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC137Q6PK04 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC137Q6PK04 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC137Q6PK04 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC137Q6PK04 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC137Q6PK04 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC137Q6PK04 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC137Q6PK04 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC137Q6PK04 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC137Q6PK04 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC137Q6PK04 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC137Q6PK04 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC137Q6PK04 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC137Q6PK04 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC137Q6PK04 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC137Q6PK04 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC137Q6PK04 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC137Q6PK04 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC137Q6PK04 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC137Q6PK04 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC137Q6PK04 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC137Q6PK04 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC137Q6PK04 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC137Q6PK04 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC137Q6PK04 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC137Q6PK04 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC137Q6PK04 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC137Q6PK04 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC137Q6PK04 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC137Q6PK04 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC137Q6PK04 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC137Q6PK04 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC137Q6PK04 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC137Q6PK04 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC137Q6PK04 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC137Q6PK04 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC137Q6PK04 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC137Q6PK04 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC137Q6PK04 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC137Q6PK04 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC137Q6PK04 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC137Q6PK04 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC137Q6PK04 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC137Q6PK04 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC137Q6PK04 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC137Q6PK04 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC137Q6PK04 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC137Q6PK04 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC137Q6PK04 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC137Q6PK04 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC137Q6PK04 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms