Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCB8

EMB, Embigin, humanhuman

Predictions only

Length 327 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMBQ6PCB8 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EMBQ6PCB8 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EMBQ6PCB8 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
EMBQ6PCB8 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EMBQ6PCB8 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EMBQ6PCB8 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EMBQ6PCB8 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EMBQ6PCB8 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EMBQ6PCB8 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EMBQ6PCB8 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EMBQ6PCB8 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EMBQ6PCB8 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EMBQ6PCB8 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EMBQ6PCB8 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EMBQ6PCB8 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EMBQ6PCB8 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EMBQ6PCB8 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EMBQ6PCB8 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EMBQ6PCB8 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EMBQ6PCB8 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EMBQ6PCB8 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EMBQ6PCB8 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EMBQ6PCB8 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EMBQ6PCB8 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EMBQ6PCB8 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EMBQ6PCB8 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EMBQ6PCB8 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
EMBQ6PCB8 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
EMBQ6PCB8 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
EMBQ6PCB8 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
EMBQ6PCB8 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
EMBQ6PCB8 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
EMBQ6PCB8 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
EMBQ6PCB8 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
EMBQ6PCB8 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
EMBQ6PCB8 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
EMBQ6PCB8 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
EMBQ6PCB8 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
EMBQ6PCB8 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
EMBQ6PCB8 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
EMBQ6PCB8 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
EMBQ6PCB8 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
EMBQ6PCB8 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
EMBQ6PCB8 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
EMBQ6PCB8 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EMBQ6PCB8 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EMBQ6PCB8 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EMBQ6PCB8 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
EMBQ6PCB8 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EMBQ6PCB8 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EMBQ6PCB8 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EMBQ6PCB8 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
EMBQ6PCB8 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EMBQ6PCB8 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EMBQ6PCB8 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EMBQ6PCB8 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EMBQ6PCB8 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EMBQ6PCB8 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EMBQ6PCB8 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EMBQ6PCB8 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EMBQ6PCB8 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EMBQ6PCB8 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EMBQ6PCB8 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EMBQ6PCB8 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EMBQ6PCB8 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EMBQ6PCB8 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EMBQ6PCB8 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EMBQ6PCB8 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EMBQ6PCB8 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EMBQ6PCB8 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EMBQ6PCB8 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EMBQ6PCB8 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EMBQ6PCB8 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EMBQ6PCB8 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EMBQ6PCB8 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EMBQ6PCB8 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EMBQ6PCB8 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EMBQ6PCB8 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EMBQ6PCB8 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EMBQ6PCB8 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EMBQ6PCB8 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EMBQ6PCB8 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EMBQ6PCB8 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EMBQ6PCB8 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EMBQ6PCB8 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EMBQ6PCB8 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EMBQ6PCB8 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EMBQ6PCB8 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EMBQ6PCB8 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EMBQ6PCB8 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EMBQ6PCB8 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EMBQ6PCB8 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EMBQ6PCB8 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EMBQ6PCB8 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
EMBQ6PCB8 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EMBQ6PCB8 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EMBQ6PCB8 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EMBQ6PCB8 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EMBQ6PCB8 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EMBQ6PCB8 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms