Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5Q4

LMOD2, Leiomodin-2, humanhuman

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMOD2Q6P5Q4 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
LMOD2Q6P5Q4 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
LMOD2Q6P5Q4 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
LMOD2Q6P5Q4 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
LMOD2Q6P5Q4 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
LMOD2Q6P5Q4 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
LMOD2Q6P5Q4 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
LMOD2Q6P5Q4 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
LMOD2Q6P5Q4 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
LMOD2Q6P5Q4 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
LMOD2Q6P5Q4 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
LMOD2Q6P5Q4 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
LMOD2Q6P5Q4 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
LMOD2Q6P5Q4 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
LMOD2Q6P5Q4 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
LMOD2Q6P5Q4 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
LMOD2Q6P5Q4 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
LMOD2Q6P5Q4 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
LMOD2Q6P5Q4 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
LMOD2Q6P5Q4 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
LMOD2Q6P5Q4 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
LMOD2Q6P5Q4 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
LMOD2Q6P5Q4 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
LMOD2Q6P5Q4 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
LMOD2Q6P5Q4 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
LMOD2Q6P5Q4 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
LMOD2Q6P5Q4 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
LMOD2Q6P5Q4 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
LMOD2Q6P5Q4 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
LMOD2Q6P5Q4 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
LMOD2Q6P5Q4 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
LMOD2Q6P5Q4 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
LMOD2Q6P5Q4 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
LMOD2Q6P5Q4 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
LMOD2Q6P5Q4 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
LMOD2Q6P5Q4 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
LMOD2Q6P5Q4 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
LMOD2Q6P5Q4 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
LMOD2Q6P5Q4 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
LMOD2Q6P5Q4 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
LMOD2Q6P5Q4 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
LMOD2Q6P5Q4 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
LMOD2Q6P5Q4 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
LMOD2Q6P5Q4 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
LMOD2Q6P5Q4 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
LMOD2Q6P5Q4 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
LMOD2Q6P5Q4 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
LMOD2Q6P5Q4 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
LMOD2Q6P5Q4 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
LMOD2Q6P5Q4 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
LMOD2Q6P5Q4 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
LMOD2Q6P5Q4 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
LMOD2Q6P5Q4 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
LMOD2Q6P5Q4 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
LMOD2Q6P5Q4 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
LMOD2Q6P5Q4 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
LMOD2Q6P5Q4 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
LMOD2Q6P5Q4 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
LMOD2Q6P5Q4 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
LMOD2Q6P5Q4 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
LMOD2Q6P5Q4 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
LMOD2Q6P5Q4 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
LMOD2Q6P5Q4 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
LMOD2Q6P5Q4 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
LMOD2Q6P5Q4 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
LMOD2Q6P5Q4 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
LMOD2Q6P5Q4 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
LMOD2Q6P5Q4 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
LMOD2Q6P5Q4 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
LMOD2Q6P5Q4 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
LMOD2Q6P5Q4 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
LMOD2Q6P5Q4 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
LMOD2Q6P5Q4 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
LMOD2Q6P5Q4 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
LMOD2Q6P5Q4 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
LMOD2Q6P5Q4 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
LMOD2Q6P5Q4 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
LMOD2Q6P5Q4 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
LMOD2Q6P5Q4 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
LMOD2Q6P5Q4 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
LMOD2Q6P5Q4 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
LMOD2Q6P5Q4 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
LMOD2Q6P5Q4 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
LMOD2Q6P5Q4 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
LMOD2Q6P5Q4 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
LMOD2Q6P5Q4 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
LMOD2Q6P5Q4 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
LMOD2Q6P5Q4 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
LMOD2Q6P5Q4 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
LMOD2Q6P5Q4 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
LMOD2Q6P5Q4 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
LMOD2Q6P5Q4 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
LMOD2Q6P5Q4 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
LMOD2Q6P5Q4 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
LMOD2Q6P5Q4 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
LMOD2Q6P5Q4 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
LMOD2Q6P5Q4 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
LMOD2Q6P5Q4 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
LMOD2Q6P5Q4 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
LMOD2Q6P5Q4 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms