Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2S7

TTC41P, Putative tetratricopeptide repeat protein 41, humanhuman

Predictions only

Length 1,318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC41PQ6P2S7 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
TTC41PQ6P2S7 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
TTC41PQ6P2S7 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC25.33■■□□□ 1.64
TTC41PQ6P2S7 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.64
TTC41PQ6P2S7 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
TTC41PQ6P2S7 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
TTC41PQ6P2S7 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.64
TTC41PQ6P2S7 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
TTC41PQ6P2S7 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.64
TTC41PQ6P2S7 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
TTC41PQ6P2S7 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
TTC41PQ6P2S7 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.64
TTC41PQ6P2S7 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
TTC41PQ6P2S7 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC25.33■■□□□ 1.64
TTC41PQ6P2S7 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC25.33■■□□□ 1.64
TTC41PQ6P2S7 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
TTC41PQ6P2S7 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.64
TTC41PQ6P2S7 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TTC41PQ6P2S7 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TTC41PQ6P2S7 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TTC41PQ6P2S7 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TTC41PQ6P2S7 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TTC41PQ6P2S7 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TTC41PQ6P2S7 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TTC41PQ6P2S7 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
TTC41PQ6P2S7 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TTC41PQ6P2S7 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TTC41PQ6P2S7 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
TTC41PQ6P2S7 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TTC41PQ6P2S7 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TTC41PQ6P2S7 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TTC41PQ6P2S7 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TTC41PQ6P2S7 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TTC41PQ6P2S7 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TTC41PQ6P2S7 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TTC41PQ6P2S7 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TTC41PQ6P2S7 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TTC41PQ6P2S7 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TTC41PQ6P2S7 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TTC41PQ6P2S7 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TTC41PQ6P2S7 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TTC41PQ6P2S7 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TTC41PQ6P2S7 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TTC41PQ6P2S7 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TTC41PQ6P2S7 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TTC41PQ6P2S7 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TTC41PQ6P2S7 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TTC41PQ6P2S7 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TTC41PQ6P2S7 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TTC41PQ6P2S7 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TTC41PQ6P2S7 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TTC41PQ6P2S7 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TTC41PQ6P2S7 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TTC41PQ6P2S7 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TTC41PQ6P2S7 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TTC41PQ6P2S7 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TTC41PQ6P2S7 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TTC41PQ6P2S7 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TTC41PQ6P2S7 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TTC41PQ6P2S7 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TTC41PQ6P2S7 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TTC41PQ6P2S7 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TTC41PQ6P2S7 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TTC41PQ6P2S7 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TTC41PQ6P2S7 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TTC41PQ6P2S7 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TTC41PQ6P2S7 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TTC41PQ6P2S7 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TTC41PQ6P2S7 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TTC41PQ6P2S7 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TTC41PQ6P2S7 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
TTC41PQ6P2S7 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TTC41PQ6P2S7 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TTC41PQ6P2S7 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TTC41PQ6P2S7 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TTC41PQ6P2S7 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TTC41PQ6P2S7 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
TTC41PQ6P2S7 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TTC41PQ6P2S7 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TTC41PQ6P2S7 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TTC41PQ6P2S7 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TTC41PQ6P2S7 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TTC41PQ6P2S7 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TTC41PQ6P2S7 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
TTC41PQ6P2S7 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
TTC41PQ6P2S7 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TTC41PQ6P2S7 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TTC41PQ6P2S7 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
TTC41PQ6P2S7 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TTC41PQ6P2S7 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TTC41PQ6P2S7 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TTC41PQ6P2S7 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TTC41PQ6P2S7 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TTC41PQ6P2S7 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TTC41PQ6P2S7 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TTC41PQ6P2S7 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TTC41PQ6P2S7 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TTC41PQ6P2S7 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TTC41PQ6P2S7 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TTC41PQ6P2S7 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms