Protein–RNA interactions for Protein: Q6NWY9

PRPF40B, Pre-mRNA-processing factor 40 homolog B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF40BQ6NWY9 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
PRPF40BQ6NWY9 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PRPF40BQ6NWY9 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PRPF40BQ6NWY9 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PRPF40BQ6NWY9 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PRPF40BQ6NWY9 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PRPF40BQ6NWY9 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PRPF40BQ6NWY9 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PRPF40BQ6NWY9 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
PRPF40BQ6NWY9 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
PRPF40BQ6NWY9 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
PRPF40BQ6NWY9 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PRPF40BQ6NWY9 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PRPF40BQ6NWY9 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PRPF40BQ6NWY9 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PRPF40BQ6NWY9 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PRPF40BQ6NWY9 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PRPF40BQ6NWY9 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PRPF40BQ6NWY9 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PRPF40BQ6NWY9 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PRPF40BQ6NWY9 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PRPF40BQ6NWY9 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PRPF40BQ6NWY9 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PRPF40BQ6NWY9 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PRPF40BQ6NWY9 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PRPF40BQ6NWY9 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PRPF40BQ6NWY9 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PRPF40BQ6NWY9 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PRPF40BQ6NWY9 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PRPF40BQ6NWY9 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
PRPF40BQ6NWY9 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PRPF40BQ6NWY9 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PRPF40BQ6NWY9 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PRPF40BQ6NWY9 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PRPF40BQ6NWY9 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PRPF40BQ6NWY9 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PRPF40BQ6NWY9 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
PRPF40BQ6NWY9 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
PRPF40BQ6NWY9 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
PRPF40BQ6NWY9 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PRPF40BQ6NWY9 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PRPF40BQ6NWY9 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PRPF40BQ6NWY9 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PRPF40BQ6NWY9 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PRPF40BQ6NWY9 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PRPF40BQ6NWY9 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PRPF40BQ6NWY9 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PRPF40BQ6NWY9 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PRPF40BQ6NWY9 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
PRPF40BQ6NWY9 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PRPF40BQ6NWY9 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PRPF40BQ6NWY9 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PRPF40BQ6NWY9 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PRPF40BQ6NWY9 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PRPF40BQ6NWY9 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PRPF40BQ6NWY9 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PRPF40BQ6NWY9 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PRPF40BQ6NWY9 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PRPF40BQ6NWY9 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
PRPF40BQ6NWY9 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PRPF40BQ6NWY9 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PRPF40BQ6NWY9 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PRPF40BQ6NWY9 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PRPF40BQ6NWY9 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PRPF40BQ6NWY9 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PRPF40BQ6NWY9 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PRPF40BQ6NWY9 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PRPF40BQ6NWY9 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PRPF40BQ6NWY9 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PRPF40BQ6NWY9 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PRPF40BQ6NWY9 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PRPF40BQ6NWY9 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PRPF40BQ6NWY9 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PRPF40BQ6NWY9 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PRPF40BQ6NWY9 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PRPF40BQ6NWY9 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PRPF40BQ6NWY9 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PRPF40BQ6NWY9 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PRPF40BQ6NWY9 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PRPF40BQ6NWY9 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PRPF40BQ6NWY9 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PRPF40BQ6NWY9 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PRPF40BQ6NWY9 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PRPF40BQ6NWY9 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
PRPF40BQ6NWY9 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PRPF40BQ6NWY9 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PRPF40BQ6NWY9 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PRPF40BQ6NWY9 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PRPF40BQ6NWY9 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PRPF40BQ6NWY9 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PRPF40BQ6NWY9 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PRPF40BQ6NWY9 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PRPF40BQ6NWY9 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PRPF40BQ6NWY9 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PRPF40BQ6NWY9 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PRPF40BQ6NWY9 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PRPF40BQ6NWY9 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PRPF40BQ6NWY9 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PRPF40BQ6NWY9 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
PRPF40BQ6NWY9 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms