Protein–RNA interactions for Protein: Q6KF10

GDF6, Growth/differentiation factor 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF6Q6KF10 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GDF6Q6KF10 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GDF6Q6KF10 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GDF6Q6KF10 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GDF6Q6KF10 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GDF6Q6KF10 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GDF6Q6KF10 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GDF6Q6KF10 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GDF6Q6KF10 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GDF6Q6KF10 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GDF6Q6KF10 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GDF6Q6KF10 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GDF6Q6KF10 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GDF6Q6KF10 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GDF6Q6KF10 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GDF6Q6KF10 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GDF6Q6KF10 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GDF6Q6KF10 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
GDF6Q6KF10 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GDF6Q6KF10 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GDF6Q6KF10 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GDF6Q6KF10 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GDF6Q6KF10 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GDF6Q6KF10 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GDF6Q6KF10 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GDF6Q6KF10 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GDF6Q6KF10 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
GDF6Q6KF10 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GDF6Q6KF10 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GDF6Q6KF10 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GDF6Q6KF10 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GDF6Q6KF10 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GDF6Q6KF10 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GDF6Q6KF10 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GDF6Q6KF10 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GDF6Q6KF10 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GDF6Q6KF10 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GDF6Q6KF10 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GDF6Q6KF10 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GDF6Q6KF10 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GDF6Q6KF10 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GDF6Q6KF10 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GDF6Q6KF10 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GDF6Q6KF10 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GDF6Q6KF10 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
GDF6Q6KF10 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GDF6Q6KF10 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GDF6Q6KF10 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GDF6Q6KF10 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
GDF6Q6KF10 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GDF6Q6KF10 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GDF6Q6KF10 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GDF6Q6KF10 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GDF6Q6KF10 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GDF6Q6KF10 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GDF6Q6KF10 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GDF6Q6KF10 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GDF6Q6KF10 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GDF6Q6KF10 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GDF6Q6KF10 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GDF6Q6KF10 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GDF6Q6KF10 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GDF6Q6KF10 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GDF6Q6KF10 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GDF6Q6KF10 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GDF6Q6KF10 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GDF6Q6KF10 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
GDF6Q6KF10 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GDF6Q6KF10 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GDF6Q6KF10 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GDF6Q6KF10 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GDF6Q6KF10 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GDF6Q6KF10 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GDF6Q6KF10 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GDF6Q6KF10 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GDF6Q6KF10 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GDF6Q6KF10 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GDF6Q6KF10 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GDF6Q6KF10 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
GDF6Q6KF10 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GDF6Q6KF10 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GDF6Q6KF10 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GDF6Q6KF10 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GDF6Q6KF10 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
GDF6Q6KF10 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GDF6Q6KF10 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GDF6Q6KF10 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GDF6Q6KF10 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GDF6Q6KF10 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GDF6Q6KF10 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GDF6Q6KF10 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GDF6Q6KF10 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GDF6Q6KF10 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GDF6Q6KF10 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GDF6Q6KF10 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GDF6Q6KF10 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GDF6Q6KF10 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GDF6Q6KF10 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GDF6Q6KF10 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GDF6Q6KF10 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms