Protein–RNA interactions for Protein: Q6JBY9

RCSD1, CapZ-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCSD1Q6JBY9 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RCSD1Q6JBY9 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RCSD1Q6JBY9 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RCSD1Q6JBY9 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RCSD1Q6JBY9 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RCSD1Q6JBY9 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RCSD1Q6JBY9 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RCSD1Q6JBY9 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RCSD1Q6JBY9 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RCSD1Q6JBY9 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RCSD1Q6JBY9 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RCSD1Q6JBY9 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RCSD1Q6JBY9 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RCSD1Q6JBY9 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
RCSD1Q6JBY9 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RCSD1Q6JBY9 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RCSD1Q6JBY9 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RCSD1Q6JBY9 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RCSD1Q6JBY9 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
RCSD1Q6JBY9 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RCSD1Q6JBY9 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RCSD1Q6JBY9 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RCSD1Q6JBY9 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RCSD1Q6JBY9 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RCSD1Q6JBY9 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
RCSD1Q6JBY9 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RCSD1Q6JBY9 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RCSD1Q6JBY9 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RCSD1Q6JBY9 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RCSD1Q6JBY9 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
RCSD1Q6JBY9 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RCSD1Q6JBY9 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RCSD1Q6JBY9 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RCSD1Q6JBY9 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RCSD1Q6JBY9 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RCSD1Q6JBY9 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RCSD1Q6JBY9 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RCSD1Q6JBY9 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
RCSD1Q6JBY9 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.48
RCSD1Q6JBY9 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
RCSD1Q6JBY9 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
RCSD1Q6JBY9 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RCSD1Q6JBY9 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RCSD1Q6JBY9 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RCSD1Q6JBY9 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RCSD1Q6JBY9 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RCSD1Q6JBY9 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RCSD1Q6JBY9 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RCSD1Q6JBY9 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
RCSD1Q6JBY9 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RCSD1Q6JBY9 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RCSD1Q6JBY9 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RCSD1Q6JBY9 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RCSD1Q6JBY9 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RCSD1Q6JBY9 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RCSD1Q6JBY9 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RCSD1Q6JBY9 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RCSD1Q6JBY9 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RCSD1Q6JBY9 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RCSD1Q6JBY9 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RCSD1Q6JBY9 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
RCSD1Q6JBY9 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
RCSD1Q6JBY9 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RCSD1Q6JBY9 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RCSD1Q6JBY9 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
RCSD1Q6JBY9 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RCSD1Q6JBY9 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RCSD1Q6JBY9 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RCSD1Q6JBY9 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RCSD1Q6JBY9 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RCSD1Q6JBY9 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RCSD1Q6JBY9 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RCSD1Q6JBY9 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
RCSD1Q6JBY9 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RCSD1Q6JBY9 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
RCSD1Q6JBY9 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RCSD1Q6JBY9 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RCSD1Q6JBY9 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RCSD1Q6JBY9 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RCSD1Q6JBY9 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RCSD1Q6JBY9 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RCSD1Q6JBY9 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RCSD1Q6JBY9 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RCSD1Q6JBY9 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RCSD1Q6JBY9 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RCSD1Q6JBY9 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RCSD1Q6JBY9 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RCSD1Q6JBY9 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RCSD1Q6JBY9 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RCSD1Q6JBY9 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RCSD1Q6JBY9 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RCSD1Q6JBY9 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RCSD1Q6JBY9 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RCSD1Q6JBY9 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RCSD1Q6JBY9 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
RCSD1Q6JBY9 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
RCSD1Q6JBY9 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RCSD1Q6JBY9 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RCSD1Q6JBY9 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RCSD1Q6JBY9 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 127.3 ms