Protein–RNA interactions for Protein: Q6IBW4

NCAPH2, Condensin-2 complex subunit H2, humanhuman

Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPH2Q6IBW4 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NCAPH2Q6IBW4 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NCAPH2Q6IBW4 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NCAPH2Q6IBW4 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NCAPH2Q6IBW4 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NCAPH2Q6IBW4 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NCAPH2Q6IBW4 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NCAPH2Q6IBW4 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NCAPH2Q6IBW4 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
NCAPH2Q6IBW4 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NCAPH2Q6IBW4 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
NCAPH2Q6IBW4 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
NCAPH2Q6IBW4 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NCAPH2Q6IBW4 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NCAPH2Q6IBW4 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NCAPH2Q6IBW4 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NCAPH2Q6IBW4 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NCAPH2Q6IBW4 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NCAPH2Q6IBW4 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NCAPH2Q6IBW4 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NCAPH2Q6IBW4 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NCAPH2Q6IBW4 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NCAPH2Q6IBW4 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NCAPH2Q6IBW4 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NCAPH2Q6IBW4 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NCAPH2Q6IBW4 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NCAPH2Q6IBW4 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NCAPH2Q6IBW4 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NCAPH2Q6IBW4 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NCAPH2Q6IBW4 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NCAPH2Q6IBW4 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NCAPH2Q6IBW4 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NCAPH2Q6IBW4 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NCAPH2Q6IBW4 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NCAPH2Q6IBW4 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NCAPH2Q6IBW4 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NCAPH2Q6IBW4 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NCAPH2Q6IBW4 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NCAPH2Q6IBW4 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NCAPH2Q6IBW4 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NCAPH2Q6IBW4 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NCAPH2Q6IBW4 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NCAPH2Q6IBW4 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NCAPH2Q6IBW4 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NCAPH2Q6IBW4 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NCAPH2Q6IBW4 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NCAPH2Q6IBW4 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NCAPH2Q6IBW4 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NCAPH2Q6IBW4 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NCAPH2Q6IBW4 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NCAPH2Q6IBW4 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NCAPH2Q6IBW4 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NCAPH2Q6IBW4 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NCAPH2Q6IBW4 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NCAPH2Q6IBW4 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
NCAPH2Q6IBW4 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
NCAPH2Q6IBW4 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NCAPH2Q6IBW4 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
NCAPH2Q6IBW4 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NCAPH2Q6IBW4 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NCAPH2Q6IBW4 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NCAPH2Q6IBW4 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NCAPH2Q6IBW4 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NCAPH2Q6IBW4 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NCAPH2Q6IBW4 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NCAPH2Q6IBW4 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NCAPH2Q6IBW4 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
NCAPH2Q6IBW4 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NCAPH2Q6IBW4 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NCAPH2Q6IBW4 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NCAPH2Q6IBW4 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NCAPH2Q6IBW4 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NCAPH2Q6IBW4 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NCAPH2Q6IBW4 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
NCAPH2Q6IBW4 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NCAPH2Q6IBW4 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NCAPH2Q6IBW4 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NCAPH2Q6IBW4 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NCAPH2Q6IBW4 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NCAPH2Q6IBW4 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NCAPH2Q6IBW4 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NCAPH2Q6IBW4 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NCAPH2Q6IBW4 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NCAPH2Q6IBW4 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NCAPH2Q6IBW4 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NCAPH2Q6IBW4 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NCAPH2Q6IBW4 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
NCAPH2Q6IBW4 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
NCAPH2Q6IBW4 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NCAPH2Q6IBW4 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NCAPH2Q6IBW4 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NCAPH2Q6IBW4 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NCAPH2Q6IBW4 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NCAPH2Q6IBW4 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
NCAPH2Q6IBW4 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NCAPH2Q6IBW4 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NCAPH2Q6IBW4 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NCAPH2Q6IBW4 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NCAPH2Q6IBW4 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NCAPH2Q6IBW4 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms