Protein–RNA interactions for Protein: Q6DN14

MCTP1, Multiple C2 and transmembrane domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 999 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCTP1Q6DN14 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MCTP1Q6DN14 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MCTP1Q6DN14 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MCTP1Q6DN14 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MCTP1Q6DN14 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MCTP1Q6DN14 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MCTP1Q6DN14 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MCTP1Q6DN14 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MCTP1Q6DN14 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
MCTP1Q6DN14 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MCTP1Q6DN14 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MCTP1Q6DN14 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MCTP1Q6DN14 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
MCTP1Q6DN14 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MCTP1Q6DN14 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MCTP1Q6DN14 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MCTP1Q6DN14 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MCTP1Q6DN14 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MCTP1Q6DN14 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
MCTP1Q6DN14 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MCTP1Q6DN14 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MCTP1Q6DN14 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MCTP1Q6DN14 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MCTP1Q6DN14 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MCTP1Q6DN14 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MCTP1Q6DN14 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MCTP1Q6DN14 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MCTP1Q6DN14 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MCTP1Q6DN14 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MCTP1Q6DN14 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MCTP1Q6DN14 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MCTP1Q6DN14 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MCTP1Q6DN14 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MCTP1Q6DN14 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MCTP1Q6DN14 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MCTP1Q6DN14 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MCTP1Q6DN14 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MCTP1Q6DN14 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MCTP1Q6DN14 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MCTP1Q6DN14 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MCTP1Q6DN14 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MCTP1Q6DN14 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
MCTP1Q6DN14 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MCTP1Q6DN14 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MCTP1Q6DN14 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MCTP1Q6DN14 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
MCTP1Q6DN14 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MCTP1Q6DN14 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MCTP1Q6DN14 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MCTP1Q6DN14 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
MCTP1Q6DN14 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
MCTP1Q6DN14 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
MCTP1Q6DN14 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
MCTP1Q6DN14 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
MCTP1Q6DN14 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
MCTP1Q6DN14 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
MCTP1Q6DN14 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
MCTP1Q6DN14 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MCTP1Q6DN14 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MCTP1Q6DN14 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MCTP1Q6DN14 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MCTP1Q6DN14 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MCTP1Q6DN14 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MCTP1Q6DN14 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MCTP1Q6DN14 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MCTP1Q6DN14 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MCTP1Q6DN14 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MCTP1Q6DN14 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MCTP1Q6DN14 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MCTP1Q6DN14 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MCTP1Q6DN14 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MCTP1Q6DN14 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MCTP1Q6DN14 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MCTP1Q6DN14 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MCTP1Q6DN14 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MCTP1Q6DN14 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MCTP1Q6DN14 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MCTP1Q6DN14 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MCTP1Q6DN14 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MCTP1Q6DN14 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MCTP1Q6DN14 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MCTP1Q6DN14 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MCTP1Q6DN14 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MCTP1Q6DN14 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MCTP1Q6DN14 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MCTP1Q6DN14 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
MCTP1Q6DN14 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MCTP1Q6DN14 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MCTP1Q6DN14 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MCTP1Q6DN14 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MCTP1Q6DN14 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MCTP1Q6DN14 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MCTP1Q6DN14 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MCTP1Q6DN14 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MCTP1Q6DN14 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MCTP1Q6DN14 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MCTP1Q6DN14 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MCTP1Q6DN14 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MCTP1Q6DN14 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MCTP1Q6DN14 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms