Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI12

ANKRD40, Ankyrin repeat domain-containing protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD40Q6AI12 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ANKRD40Q6AI12 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ANKRD40Q6AI12 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ANKRD40Q6AI12 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ANKRD40Q6AI12 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ANKRD40Q6AI12 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ANKRD40Q6AI12 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ANKRD40Q6AI12 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ANKRD40Q6AI12 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ANKRD40Q6AI12 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ANKRD40Q6AI12 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ANKRD40Q6AI12 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ANKRD40Q6AI12 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ANKRD40Q6AI12 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ANKRD40Q6AI12 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ANKRD40Q6AI12 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ANKRD40Q6AI12 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ANKRD40Q6AI12 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ANKRD40Q6AI12 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ANKRD40Q6AI12 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ANKRD40Q6AI12 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ANKRD40Q6AI12 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ANKRD40Q6AI12 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
ANKRD40Q6AI12 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
ANKRD40Q6AI12 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ANKRD40Q6AI12 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ANKRD40Q6AI12 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ANKRD40Q6AI12 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ANKRD40Q6AI12 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ANKRD40Q6AI12 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ANKRD40Q6AI12 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ANKRD40Q6AI12 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ANKRD40Q6AI12 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ANKRD40Q6AI12 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ANKRD40Q6AI12 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ANKRD40Q6AI12 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ANKRD40Q6AI12 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ANKRD40Q6AI12 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ANKRD40Q6AI12 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
ANKRD40Q6AI12 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ANKRD40Q6AI12 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ANKRD40Q6AI12 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ANKRD40Q6AI12 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ANKRD40Q6AI12 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ANKRD40Q6AI12 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ANKRD40Q6AI12 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ANKRD40Q6AI12 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ANKRD40Q6AI12 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ANKRD40Q6AI12 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ANKRD40Q6AI12 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ANKRD40Q6AI12 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ANKRD40Q6AI12 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ANKRD40Q6AI12 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ANKRD40Q6AI12 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ANKRD40Q6AI12 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ANKRD40Q6AI12 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ANKRD40Q6AI12 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ANKRD40Q6AI12 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ANKRD40Q6AI12 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ANKRD40Q6AI12 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ANKRD40Q6AI12 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ANKRD40Q6AI12 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ANKRD40Q6AI12 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ANKRD40Q6AI12 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ANKRD40Q6AI12 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ANKRD40Q6AI12 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
ANKRD40Q6AI12 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
ANKRD40Q6AI12 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ANKRD40Q6AI12 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ANKRD40Q6AI12 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ANKRD40Q6AI12 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ANKRD40Q6AI12 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ANKRD40Q6AI12 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ANKRD40Q6AI12 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ANKRD40Q6AI12 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
ANKRD40Q6AI12 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ANKRD40Q6AI12 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ANKRD40Q6AI12 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ANKRD40Q6AI12 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ANKRD40Q6AI12 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ANKRD40Q6AI12 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ANKRD40Q6AI12 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ANKRD40Q6AI12 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ANKRD40Q6AI12 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ANKRD40Q6AI12 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ANKRD40Q6AI12 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ANKRD40Q6AI12 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ANKRD40Q6AI12 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ANKRD40Q6AI12 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ANKRD40Q6AI12 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ANKRD40Q6AI12 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ANKRD40Q6AI12 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ANKRD40Q6AI12 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ANKRD40Q6AI12 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ANKRD40Q6AI12 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ANKRD40Q6AI12 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ANKRD40Q6AI12 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ANKRD40Q6AI12 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ANKRD40Q6AI12 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ANKRD40Q6AI12 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms