Protein–RNA interactions for Protein: Q69YQ0

SPECC1L, Cytospin-A, humanhuman

Predictions only

Length 1,117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPECC1LQ69YQ0 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SPECC1LQ69YQ0 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPECC1LQ69YQ0 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPECC1LQ69YQ0 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPECC1LQ69YQ0 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPECC1LQ69YQ0 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPECC1LQ69YQ0 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPECC1LQ69YQ0 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
SPECC1LQ69YQ0 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
SPECC1LQ69YQ0 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPECC1LQ69YQ0 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPECC1LQ69YQ0 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPECC1LQ69YQ0 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPECC1LQ69YQ0 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SPECC1LQ69YQ0 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPECC1LQ69YQ0 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPECC1LQ69YQ0 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPECC1LQ69YQ0 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPECC1LQ69YQ0 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPECC1LQ69YQ0 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPECC1LQ69YQ0 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPECC1LQ69YQ0 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPECC1LQ69YQ0 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPECC1LQ69YQ0 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPECC1LQ69YQ0 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPECC1LQ69YQ0 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPECC1LQ69YQ0 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPECC1LQ69YQ0 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPECC1LQ69YQ0 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPECC1LQ69YQ0 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPECC1LQ69YQ0 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPECC1LQ69YQ0 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPECC1LQ69YQ0 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPECC1LQ69YQ0 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPECC1LQ69YQ0 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPECC1LQ69YQ0 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPECC1LQ69YQ0 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPECC1LQ69YQ0 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPECC1LQ69YQ0 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPECC1LQ69YQ0 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPECC1LQ69YQ0 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPECC1LQ69YQ0 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPECC1LQ69YQ0 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPECC1LQ69YQ0 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPECC1LQ69YQ0 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPECC1LQ69YQ0 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPECC1LQ69YQ0 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPECC1LQ69YQ0 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPECC1LQ69YQ0 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPECC1LQ69YQ0 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPECC1LQ69YQ0 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPECC1LQ69YQ0 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPECC1LQ69YQ0 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPECC1LQ69YQ0 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPECC1LQ69YQ0 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPECC1LQ69YQ0 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPECC1LQ69YQ0 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPECC1LQ69YQ0 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPECC1LQ69YQ0 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPECC1LQ69YQ0 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPECC1LQ69YQ0 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPECC1LQ69YQ0 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPECC1LQ69YQ0 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SPECC1LQ69YQ0 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPECC1LQ69YQ0 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPECC1LQ69YQ0 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPECC1LQ69YQ0 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SPECC1LQ69YQ0 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPECC1LQ69YQ0 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPECC1LQ69YQ0 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPECC1LQ69YQ0 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPECC1LQ69YQ0 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SPECC1LQ69YQ0 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPECC1LQ69YQ0 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPECC1LQ69YQ0 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPECC1LQ69YQ0 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPECC1LQ69YQ0 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPECC1LQ69YQ0 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPECC1LQ69YQ0 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPECC1LQ69YQ0 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPECC1LQ69YQ0 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPECC1LQ69YQ0 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPECC1LQ69YQ0 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPECC1LQ69YQ0 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SPECC1LQ69YQ0 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPECC1LQ69YQ0 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPECC1LQ69YQ0 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPECC1LQ69YQ0 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPECC1LQ69YQ0 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPECC1LQ69YQ0 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPECC1LQ69YQ0 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPECC1LQ69YQ0 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPECC1LQ69YQ0 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPECC1LQ69YQ0 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPECC1LQ69YQ0 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPECC1LQ69YQ0 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPECC1LQ69YQ0 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPECC1LQ69YQ0 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPECC1LQ69YQ0 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPECC1LQ69YQ0 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.2 ms