Protein–RNA interactions for Protein: Q68CZ2

TNS3, Tensin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNS3Q68CZ2 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TNS3Q68CZ2 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TNS3Q68CZ2 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TNS3Q68CZ2 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TNS3Q68CZ2 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TNS3Q68CZ2 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TNS3Q68CZ2 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TNS3Q68CZ2 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TNS3Q68CZ2 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TNS3Q68CZ2 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
TNS3Q68CZ2 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TNS3Q68CZ2 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TNS3Q68CZ2 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TNS3Q68CZ2 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TNS3Q68CZ2 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TNS3Q68CZ2 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TNS3Q68CZ2 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TNS3Q68CZ2 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TNS3Q68CZ2 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TNS3Q68CZ2 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TNS3Q68CZ2 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TNS3Q68CZ2 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
TNS3Q68CZ2 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TNS3Q68CZ2 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TNS3Q68CZ2 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TNS3Q68CZ2 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TNS3Q68CZ2 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TNS3Q68CZ2 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TNS3Q68CZ2 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
TNS3Q68CZ2 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TNS3Q68CZ2 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TNS3Q68CZ2 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TNS3Q68CZ2 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
TNS3Q68CZ2 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TNS3Q68CZ2 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
TNS3Q68CZ2 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TNS3Q68CZ2 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
TNS3Q68CZ2 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
TNS3Q68CZ2 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
TNS3Q68CZ2 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TNS3Q68CZ2 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TNS3Q68CZ2 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TNS3Q68CZ2 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TNS3Q68CZ2 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TNS3Q68CZ2 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
TNS3Q68CZ2 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.12
TNS3Q68CZ2 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
TNS3Q68CZ2 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
TNS3Q68CZ2 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.12
TNS3Q68CZ2 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
TNS3Q68CZ2 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TNS3Q68CZ2 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
TNS3Q68CZ2 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TNS3Q68CZ2 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TNS3Q68CZ2 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
TNS3Q68CZ2 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
TNS3Q68CZ2 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
TNS3Q68CZ2 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
TNS3Q68CZ2 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TNS3Q68CZ2 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
TNS3Q68CZ2 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TNS3Q68CZ2 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TNS3Q68CZ2 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TNS3Q68CZ2 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TNS3Q68CZ2 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TNS3Q68CZ2 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TNS3Q68CZ2 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TNS3Q68CZ2 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TNS3Q68CZ2 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TNS3Q68CZ2 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TNS3Q68CZ2 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
TNS3Q68CZ2 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TNS3Q68CZ2 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TNS3Q68CZ2 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TNS3Q68CZ2 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TNS3Q68CZ2 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TNS3Q68CZ2 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TNS3Q68CZ2 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TNS3Q68CZ2 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TNS3Q68CZ2 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TNS3Q68CZ2 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TNS3Q68CZ2 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TNS3Q68CZ2 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
TNS3Q68CZ2 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TNS3Q68CZ2 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TNS3Q68CZ2 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TNS3Q68CZ2 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TNS3Q68CZ2 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TNS3Q68CZ2 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TNS3Q68CZ2 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TNS3Q68CZ2 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TNS3Q68CZ2 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TNS3Q68CZ2 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TNS3Q68CZ2 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TNS3Q68CZ2 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TNS3Q68CZ2 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TNS3Q68CZ2 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TNS3Q68CZ2 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TNS3Q68CZ2 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TNS3Q68CZ2 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
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