Protein–RNA interactions for Protein: Q60I27

ALS2CL, ALS2 C-terminal-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALS2CLQ60I27 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ALS2CLQ60I27 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ALS2CLQ60I27 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ALS2CLQ60I27 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
ALS2CLQ60I27 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ALS2CLQ60I27 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ALS2CLQ60I27 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ALS2CLQ60I27 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ALS2CLQ60I27 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ALS2CLQ60I27 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ALS2CLQ60I27 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ALS2CLQ60I27 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ALS2CLQ60I27 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ALS2CLQ60I27 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ALS2CLQ60I27 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ALS2CLQ60I27 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ALS2CLQ60I27 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ALS2CLQ60I27 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ALS2CLQ60I27 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ALS2CLQ60I27 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ALS2CLQ60I27 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ALS2CLQ60I27 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
ALS2CLQ60I27 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ALS2CLQ60I27 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ALS2CLQ60I27 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ALS2CLQ60I27 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ALS2CLQ60I27 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ALS2CLQ60I27 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ALS2CLQ60I27 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ALS2CLQ60I27 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ALS2CLQ60I27 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ALS2CLQ60I27 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ALS2CLQ60I27 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ALS2CLQ60I27 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
ALS2CLQ60I27 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ALS2CLQ60I27 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ALS2CLQ60I27 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ALS2CLQ60I27 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ALS2CLQ60I27 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ALS2CLQ60I27 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ALS2CLQ60I27 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ALS2CLQ60I27 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ALS2CLQ60I27 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ALS2CLQ60I27 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ALS2CLQ60I27 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ALS2CLQ60I27 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ALS2CLQ60I27 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ALS2CLQ60I27 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ALS2CLQ60I27 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ALS2CLQ60I27 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ALS2CLQ60I27 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ALS2CLQ60I27 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ALS2CLQ60I27 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ALS2CLQ60I27 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ALS2CLQ60I27 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ALS2CLQ60I27 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ALS2CLQ60I27 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
ALS2CLQ60I27 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ALS2CLQ60I27 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ALS2CLQ60I27 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ALS2CLQ60I27 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ALS2CLQ60I27 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ALS2CLQ60I27 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ALS2CLQ60I27 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ALS2CLQ60I27 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ALS2CLQ60I27 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ALS2CLQ60I27 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ALS2CLQ60I27 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ALS2CLQ60I27 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ALS2CLQ60I27 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ALS2CLQ60I27 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ALS2CLQ60I27 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ALS2CLQ60I27 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ALS2CLQ60I27 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ALS2CLQ60I27 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ALS2CLQ60I27 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ALS2CLQ60I27 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ALS2CLQ60I27 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ALS2CLQ60I27 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ALS2CLQ60I27 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ALS2CLQ60I27 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ALS2CLQ60I27 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
ALS2CLQ60I27 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ALS2CLQ60I27 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ALS2CLQ60I27 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ALS2CLQ60I27 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ALS2CLQ60I27 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ALS2CLQ60I27 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ALS2CLQ60I27 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ALS2CLQ60I27 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ALS2CLQ60I27 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ALS2CLQ60I27 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ALS2CLQ60I27 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ALS2CLQ60I27 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ALS2CLQ60I27 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ALS2CLQ60I27 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ALS2CLQ60I27 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ALS2CLQ60I27 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ALS2CLQ60I27 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ALS2CLQ60I27 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms