Protein–RNA interactions for Protein: Q5VZK9

CARMIL1, F-actin-uncapping protein LRRC16A, humanhuman

Predictions only

Length 1,371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL1Q5VZK9 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
CARMIL1Q5VZK9 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
CARMIL1Q5VZK9 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
CARMIL1Q5VZK9 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
CARMIL1Q5VZK9 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
CARMIL1Q5VZK9 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
CARMIL1Q5VZK9 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
CARMIL1Q5VZK9 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
CARMIL1Q5VZK9 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
CARMIL1Q5VZK9 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
CARMIL1Q5VZK9 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
CARMIL1Q5VZK9 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
CARMIL1Q5VZK9 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.04
CARMIL1Q5VZK9 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
CARMIL1Q5VZK9 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
CARMIL1Q5VZK9 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.04
CARMIL1Q5VZK9 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
CARMIL1Q5VZK9 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.04
CARMIL1Q5VZK9 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.03
CARMIL1Q5VZK9 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
CARMIL1Q5VZK9 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
CARMIL1Q5VZK9 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.03
CARMIL1Q5VZK9 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
CARMIL1Q5VZK9 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC34■■■■□ 3.03
CARMIL1Q5VZK9 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
CARMIL1Q5VZK9 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
CARMIL1Q5VZK9 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
CARMIL1Q5VZK9 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC34■■■■□ 3.03
CARMIL1Q5VZK9 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
CARMIL1Q5VZK9 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
CARMIL1Q5VZK9 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
CARMIL1Q5VZK9 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
CARMIL1Q5VZK9 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
CARMIL1Q5VZK9 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
CARMIL1Q5VZK9 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
CARMIL1Q5VZK9 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
CARMIL1Q5VZK9 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
CARMIL1Q5VZK9 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
CARMIL1Q5VZK9 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
CARMIL1Q5VZK9 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC33.99■■■■□ 3.03
CARMIL1Q5VZK9 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
CARMIL1Q5VZK9 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
CARMIL1Q5VZK9 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
CARMIL1Q5VZK9 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
CARMIL1Q5VZK9 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
CARMIL1Q5VZK9 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
CARMIL1Q5VZK9 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
CARMIL1Q5VZK9 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
CARMIL1Q5VZK9 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC33.98■■■■□ 3.03
CARMIL1Q5VZK9 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
CARMIL1Q5VZK9 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
CARMIL1Q5VZK9 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
CARMIL1Q5VZK9 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
CARMIL1Q5VZK9 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
CARMIL1Q5VZK9 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC33.98■■■■□ 3.03
CARMIL1Q5VZK9 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
CARMIL1Q5VZK9 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
CARMIL1Q5VZK9 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
CARMIL1Q5VZK9 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
CARMIL1Q5VZK9 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
CARMIL1Q5VZK9 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
CARMIL1Q5VZK9 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC33.98■■■■□ 3.03
CARMIL1Q5VZK9 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
CARMIL1Q5VZK9 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
CARMIL1Q5VZK9 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
CARMIL1Q5VZK9 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
CARMIL1Q5VZK9 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
CARMIL1Q5VZK9 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC33.97■■■■□ 3.03
CARMIL1Q5VZK9 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
CARMIL1Q5VZK9 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
CARMIL1Q5VZK9 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
CARMIL1Q5VZK9 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
CARMIL1Q5VZK9 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
CARMIL1Q5VZK9 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
CARMIL1Q5VZK9 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
CARMIL1Q5VZK9 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
CARMIL1Q5VZK9 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
CARMIL1Q5VZK9 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
CARMIL1Q5VZK9 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
CARMIL1Q5VZK9 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.96■■■■□ 3.03
CARMIL1Q5VZK9 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC33.96■■■■□ 3.03
CARMIL1Q5VZK9 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
CARMIL1Q5VZK9 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
CARMIL1Q5VZK9 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
CARMIL1Q5VZK9 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
CARMIL1Q5VZK9 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
CARMIL1Q5VZK9 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
CARMIL1Q5VZK9 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
CARMIL1Q5VZK9 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
CARMIL1Q5VZK9 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
CARMIL1Q5VZK9 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC33.95■■■■□ 3.02
CARMIL1Q5VZK9 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
CARMIL1Q5VZK9 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.02
CARMIL1Q5VZK9 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.02
CARMIL1Q5VZK9 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
CARMIL1Q5VZK9 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
CARMIL1Q5VZK9 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
CARMIL1Q5VZK9 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
CARMIL1Q5VZK9 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
CARMIL1Q5VZK9 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms