Protein–RNA interactions for Protein: Q5VYV7

SLX4IP, Protein SLX4IP, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLX4IPQ5VYV7 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SLX4IPQ5VYV7 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SLX4IPQ5VYV7 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SLX4IPQ5VYV7 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SLX4IPQ5VYV7 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SLX4IPQ5VYV7 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SLX4IPQ5VYV7 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SLX4IPQ5VYV7 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SLX4IPQ5VYV7 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
SLX4IPQ5VYV7 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SLX4IPQ5VYV7 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SLX4IPQ5VYV7 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SLX4IPQ5VYV7 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SLX4IPQ5VYV7 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SLX4IPQ5VYV7 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SLX4IPQ5VYV7 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SLX4IPQ5VYV7 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SLX4IPQ5VYV7 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
SLX4IPQ5VYV7 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SLX4IPQ5VYV7 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SLX4IPQ5VYV7 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
SLX4IPQ5VYV7 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
SLX4IPQ5VYV7 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.62
SLX4IPQ5VYV7 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
SLX4IPQ5VYV7 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
SLX4IPQ5VYV7 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SLX4IPQ5VYV7 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SLX4IPQ5VYV7 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SLX4IPQ5VYV7 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SLX4IPQ5VYV7 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SLX4IPQ5VYV7 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SLX4IPQ5VYV7 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SLX4IPQ5VYV7 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SLX4IPQ5VYV7 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SLX4IPQ5VYV7 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SLX4IPQ5VYV7 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SLX4IPQ5VYV7 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SLX4IPQ5VYV7 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SLX4IPQ5VYV7 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SLX4IPQ5VYV7 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SLX4IPQ5VYV7 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SLX4IPQ5VYV7 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SLX4IPQ5VYV7 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
SLX4IPQ5VYV7 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SLX4IPQ5VYV7 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SLX4IPQ5VYV7 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SLX4IPQ5VYV7 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SLX4IPQ5VYV7 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SLX4IPQ5VYV7 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SLX4IPQ5VYV7 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SLX4IPQ5VYV7 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
SLX4IPQ5VYV7 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SLX4IPQ5VYV7 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SLX4IPQ5VYV7 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SLX4IPQ5VYV7 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SLX4IPQ5VYV7 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SLX4IPQ5VYV7 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SLX4IPQ5VYV7 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SLX4IPQ5VYV7 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SLX4IPQ5VYV7 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SLX4IPQ5VYV7 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SLX4IPQ5VYV7 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SLX4IPQ5VYV7 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SLX4IPQ5VYV7 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SLX4IPQ5VYV7 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SLX4IPQ5VYV7 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SLX4IPQ5VYV7 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SLX4IPQ5VYV7 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SLX4IPQ5VYV7 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SLX4IPQ5VYV7 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SLX4IPQ5VYV7 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SLX4IPQ5VYV7 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SLX4IPQ5VYV7 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SLX4IPQ5VYV7 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SLX4IPQ5VYV7 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SLX4IPQ5VYV7 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SLX4IPQ5VYV7 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SLX4IPQ5VYV7 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SLX4IPQ5VYV7 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SLX4IPQ5VYV7 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SLX4IPQ5VYV7 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SLX4IPQ5VYV7 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SLX4IPQ5VYV7 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
SLX4IPQ5VYV7 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SLX4IPQ5VYV7 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
SLX4IPQ5VYV7 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLX4IPQ5VYV7 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLX4IPQ5VYV7 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLX4IPQ5VYV7 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLX4IPQ5VYV7 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLX4IPQ5VYV7 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLX4IPQ5VYV7 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLX4IPQ5VYV7 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLX4IPQ5VYV7 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLX4IPQ5VYV7 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLX4IPQ5VYV7 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLX4IPQ5VYV7 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLX4IPQ5VYV7 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLX4IPQ5VYV7 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLX4IPQ5VYV7 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms