Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWP2

FAM46C, Putative nucleotidyltransferase FAM46C, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM46CQ5VWP2 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC20.88■□□□□ 0.93
FAM46CQ5VWP2 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC20.88■□□□□ 0.93
FAM46CQ5VWP2 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
FAM46CQ5VWP2 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
FAM46CQ5VWP2 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
FAM46CQ5VWP2 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
FAM46CQ5VWP2 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
FAM46CQ5VWP2 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
FAM46CQ5VWP2 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
FAM46CQ5VWP2 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
FAM46CQ5VWP2 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
FAM46CQ5VWP2 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
FAM46CQ5VWP2 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
FAM46CQ5VWP2 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
FAM46CQ5VWP2 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
FAM46CQ5VWP2 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
FAM46CQ5VWP2 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC20.87■□□□□ 0.93
FAM46CQ5VWP2 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
FAM46CQ5VWP2 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
FAM46CQ5VWP2 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
FAM46CQ5VWP2 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
FAM46CQ5VWP2 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
FAM46CQ5VWP2 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
FAM46CQ5VWP2 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
FAM46CQ5VWP2 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
FAM46CQ5VWP2 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
FAM46CQ5VWP2 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
FAM46CQ5VWP2 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
FAM46CQ5VWP2 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC20.86■□□□□ 0.93
FAM46CQ5VWP2 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
FAM46CQ5VWP2 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
FAM46CQ5VWP2 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
FAM46CQ5VWP2 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
FAM46CQ5VWP2 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
FAM46CQ5VWP2 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
FAM46CQ5VWP2 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
FAM46CQ5VWP2 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
FAM46CQ5VWP2 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
FAM46CQ5VWP2 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
FAM46CQ5VWP2 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
FAM46CQ5VWP2 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
FAM46CQ5VWP2 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
FAM46CQ5VWP2 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
FAM46CQ5VWP2 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
FAM46CQ5VWP2 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
FAM46CQ5VWP2 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
FAM46CQ5VWP2 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
FAM46CQ5VWP2 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
FAM46CQ5VWP2 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
FAM46CQ5VWP2 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC20.85■□□□□ 0.93
FAM46CQ5VWP2 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
FAM46CQ5VWP2 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
FAM46CQ5VWP2 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
FAM46CQ5VWP2 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
FAM46CQ5VWP2 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
FAM46CQ5VWP2 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
FAM46CQ5VWP2 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
FAM46CQ5VWP2 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
FAM46CQ5VWP2 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
FAM46CQ5VWP2 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
FAM46CQ5VWP2 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
FAM46CQ5VWP2 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
FAM46CQ5VWP2 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
FAM46CQ5VWP2 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
FAM46CQ5VWP2 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
FAM46CQ5VWP2 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
FAM46CQ5VWP2 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
FAM46CQ5VWP2 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
FAM46CQ5VWP2 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC20.84■□□□□ 0.93
FAM46CQ5VWP2 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
FAM46CQ5VWP2 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
FAM46CQ5VWP2 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
FAM46CQ5VWP2 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
FAM46CQ5VWP2 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
FAM46CQ5VWP2 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
FAM46CQ5VWP2 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
FAM46CQ5VWP2 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
FAM46CQ5VWP2 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
FAM46CQ5VWP2 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
FAM46CQ5VWP2 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
FAM46CQ5VWP2 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
FAM46CQ5VWP2 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
FAM46CQ5VWP2 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
FAM46CQ5VWP2 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
FAM46CQ5VWP2 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
FAM46CQ5VWP2 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
FAM46CQ5VWP2 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
FAM46CQ5VWP2 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
FAM46CQ5VWP2 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
FAM46CQ5VWP2 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC20.83■□□□□ 0.93
FAM46CQ5VWP2 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
FAM46CQ5VWP2 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
FAM46CQ5VWP2 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
FAM46CQ5VWP2 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
FAM46CQ5VWP2 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
FAM46CQ5VWP2 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.92
FAM46CQ5VWP2 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
FAM46CQ5VWP2 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
FAM46CQ5VWP2 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
FAM46CQ5VWP2 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
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