Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGL8

PXDC1, PX domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PXDC1Q5TGL8 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PXDC1Q5TGL8 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PXDC1Q5TGL8 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PXDC1Q5TGL8 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PXDC1Q5TGL8 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PXDC1Q5TGL8 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PXDC1Q5TGL8 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PXDC1Q5TGL8 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PXDC1Q5TGL8 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PXDC1Q5TGL8 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PXDC1Q5TGL8 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PXDC1Q5TGL8 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PXDC1Q5TGL8 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PXDC1Q5TGL8 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PXDC1Q5TGL8 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PXDC1Q5TGL8 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PXDC1Q5TGL8 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PXDC1Q5TGL8 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PXDC1Q5TGL8 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PXDC1Q5TGL8 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PXDC1Q5TGL8 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PXDC1Q5TGL8 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PXDC1Q5TGL8 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
PXDC1Q5TGL8 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
PXDC1Q5TGL8 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PXDC1Q5TGL8 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PXDC1Q5TGL8 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PXDC1Q5TGL8 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PXDC1Q5TGL8 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PXDC1Q5TGL8 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PXDC1Q5TGL8 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PXDC1Q5TGL8 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PXDC1Q5TGL8 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PXDC1Q5TGL8 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PXDC1Q5TGL8 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PXDC1Q5TGL8 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PXDC1Q5TGL8 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
PXDC1Q5TGL8 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
PXDC1Q5TGL8 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PXDC1Q5TGL8 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PXDC1Q5TGL8 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PXDC1Q5TGL8 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PXDC1Q5TGL8 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PXDC1Q5TGL8 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
PXDC1Q5TGL8 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PXDC1Q5TGL8 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PXDC1Q5TGL8 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PXDC1Q5TGL8 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PXDC1Q5TGL8 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
PXDC1Q5TGL8 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
PXDC1Q5TGL8 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PXDC1Q5TGL8 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PXDC1Q5TGL8 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PXDC1Q5TGL8 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PXDC1Q5TGL8 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PXDC1Q5TGL8 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PXDC1Q5TGL8 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PXDC1Q5TGL8 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PXDC1Q5TGL8 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PXDC1Q5TGL8 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PXDC1Q5TGL8 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PXDC1Q5TGL8 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PXDC1Q5TGL8 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PXDC1Q5TGL8 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PXDC1Q5TGL8 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PXDC1Q5TGL8 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PXDC1Q5TGL8 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PXDC1Q5TGL8 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PXDC1Q5TGL8 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PXDC1Q5TGL8 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PXDC1Q5TGL8 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PXDC1Q5TGL8 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PXDC1Q5TGL8 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PXDC1Q5TGL8 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PXDC1Q5TGL8 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PXDC1Q5TGL8 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PXDC1Q5TGL8 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PXDC1Q5TGL8 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PXDC1Q5TGL8 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PXDC1Q5TGL8 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PXDC1Q5TGL8 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PXDC1Q5TGL8 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PXDC1Q5TGL8 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PXDC1Q5TGL8 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PXDC1Q5TGL8 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PXDC1Q5TGL8 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PXDC1Q5TGL8 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PXDC1Q5TGL8 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PXDC1Q5TGL8 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PXDC1Q5TGL8 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PXDC1Q5TGL8 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PXDC1Q5TGL8 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PXDC1Q5TGL8 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PXDC1Q5TGL8 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PXDC1Q5TGL8 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PXDC1Q5TGL8 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PXDC1Q5TGL8 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PXDC1Q5TGL8 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PXDC1Q5TGL8 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PXDC1Q5TGL8 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms