Protein–RNA interactions for Protein: Q5T5S1

CCDC183, Coiled-coil domain-containing protein 183, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC183Q5T5S1 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC183Q5T5S1 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC183Q5T5S1 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC183Q5T5S1 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC183Q5T5S1 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC183Q5T5S1 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC183Q5T5S1 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC183Q5T5S1 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC183Q5T5S1 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC183Q5T5S1 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC183Q5T5S1 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC183Q5T5S1 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC183Q5T5S1 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC183Q5T5S1 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC183Q5T5S1 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC183Q5T5S1 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC183Q5T5S1 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC183Q5T5S1 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC183Q5T5S1 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC183Q5T5S1 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC183Q5T5S1 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC183Q5T5S1 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC183Q5T5S1 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC183Q5T5S1 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC183Q5T5S1 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC183Q5T5S1 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC183Q5T5S1 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC183Q5T5S1 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC183Q5T5S1 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC183Q5T5S1 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC183Q5T5S1 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC183Q5T5S1 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC183Q5T5S1 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC183Q5T5S1 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC183Q5T5S1 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC183Q5T5S1 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC183Q5T5S1 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC183Q5T5S1 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC183Q5T5S1 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC183Q5T5S1 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC183Q5T5S1 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC183Q5T5S1 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC183Q5T5S1 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC183Q5T5S1 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC183Q5T5S1 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC183Q5T5S1 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC183Q5T5S1 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC183Q5T5S1 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC183Q5T5S1 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC183Q5T5S1 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC183Q5T5S1 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC183Q5T5S1 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC183Q5T5S1 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CCDC183Q5T5S1 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CCDC183Q5T5S1 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC183Q5T5S1 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC183Q5T5S1 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC183Q5T5S1 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC183Q5T5S1 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC183Q5T5S1 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC183Q5T5S1 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC183Q5T5S1 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC183Q5T5S1 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC183Q5T5S1 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC183Q5T5S1 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC183Q5T5S1 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC183Q5T5S1 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC183Q5T5S1 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC183Q5T5S1 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC183Q5T5S1 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC183Q5T5S1 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC183Q5T5S1 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC183Q5T5S1 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC183Q5T5S1 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC183Q5T5S1 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC183Q5T5S1 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC183Q5T5S1 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC183Q5T5S1 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC183Q5T5S1 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC183Q5T5S1 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC183Q5T5S1 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC183Q5T5S1 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC183Q5T5S1 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC183Q5T5S1 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC183Q5T5S1 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC183Q5T5S1 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC183Q5T5S1 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC183Q5T5S1 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC183Q5T5S1 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC183Q5T5S1 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC183Q5T5S1 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC183Q5T5S1 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC183Q5T5S1 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC183Q5T5S1 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC183Q5T5S1 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC183Q5T5S1 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC183Q5T5S1 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC183Q5T5S1 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC183Q5T5S1 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC183Q5T5S1 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms