Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYB0

FRMPD1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD1Q5SYB0 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
FRMPD1Q5SYB0 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
FRMPD1Q5SYB0 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.58■■■□□ 2.65
FRMPD1Q5SYB0 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.58■■■□□ 2.65
FRMPD1Q5SYB0 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
FRMPD1Q5SYB0 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
FRMPD1Q5SYB0 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC31.58■■■□□ 2.65
FRMPD1Q5SYB0 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
FRMPD1Q5SYB0 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC31.58■■■□□ 2.65
FRMPD1Q5SYB0 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC31.58■■■□□ 2.65
FRMPD1Q5SYB0 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC31.58■■■□□ 2.65
FRMPD1Q5SYB0 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC31.58■■■□□ 2.65
FRMPD1Q5SYB0 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.58■■■□□ 2.65
FRMPD1Q5SYB0 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
FRMPD1Q5SYB0 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC31.58■■■□□ 2.65
FRMPD1Q5SYB0 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC31.58■■■□□ 2.65
FRMPD1Q5SYB0 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
FRMPD1Q5SYB0 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
FRMPD1Q5SYB0 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC31.57■■■□□ 2.64
FRMPD1Q5SYB0 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
FRMPD1Q5SYB0 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
FRMPD1Q5SYB0 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.64
FRMPD1Q5SYB0 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.64
FRMPD1Q5SYB0 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
FRMPD1Q5SYB0 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
FRMPD1Q5SYB0 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.56■■■□□ 2.64
FRMPD1Q5SYB0 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC31.56■■■□□ 2.64
FRMPD1Q5SYB0 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
FRMPD1Q5SYB0 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC31.56■■■□□ 2.64
FRMPD1Q5SYB0 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
FRMPD1Q5SYB0 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.56■■■□□ 2.64
FRMPD1Q5SYB0 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC31.56■■■□□ 2.64
FRMPD1Q5SYB0 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
FRMPD1Q5SYB0 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
FRMPD1Q5SYB0 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.56■■■□□ 2.64
FRMPD1Q5SYB0 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC31.56■■■□□ 2.64
FRMPD1Q5SYB0 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
FRMPD1Q5SYB0 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC31.56■■■□□ 2.64
FRMPD1Q5SYB0 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
FRMPD1Q5SYB0 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
FRMPD1Q5SYB0 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
FRMPD1Q5SYB0 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
FRMPD1Q5SYB0 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
FRMPD1Q5SYB0 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
FRMPD1Q5SYB0 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
FRMPD1Q5SYB0 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC31.55■■■□□ 2.64
FRMPD1Q5SYB0 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
FRMPD1Q5SYB0 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
FRMPD1Q5SYB0 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC31.55■■■□□ 2.64
FRMPD1Q5SYB0 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC31.55■■■□□ 2.64
FRMPD1Q5SYB0 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
FRMPD1Q5SYB0 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
FRMPD1Q5SYB0 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
FRMPD1Q5SYB0 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
FRMPD1Q5SYB0 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
FRMPD1Q5SYB0 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
FRMPD1Q5SYB0 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC31.54■■■□□ 2.64
FRMPD1Q5SYB0 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
FRMPD1Q5SYB0 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC31.54■■■□□ 2.64
FRMPD1Q5SYB0 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC31.54■■■□□ 2.64
FRMPD1Q5SYB0 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC31.54■■■□□ 2.64
FRMPD1Q5SYB0 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC31.54■■■□□ 2.64
FRMPD1Q5SYB0 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
FRMPD1Q5SYB0 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC31.54■■■□□ 2.64
FRMPD1Q5SYB0 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC31.54■■■□□ 2.64
FRMPD1Q5SYB0 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
FRMPD1Q5SYB0 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
FRMPD1Q5SYB0 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
FRMPD1Q5SYB0 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
FRMPD1Q5SYB0 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC31.53■■■□□ 2.64
FRMPD1Q5SYB0 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
FRMPD1Q5SYB0 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC31.53■■■□□ 2.64
FRMPD1Q5SYB0 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC31.53■■■□□ 2.64
FRMPD1Q5SYB0 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC31.53■■■□□ 2.64
FRMPD1Q5SYB0 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC31.52■■■□□ 2.64
FRMPD1Q5SYB0 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
FRMPD1Q5SYB0 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC31.52■■■□□ 2.64
FRMPD1Q5SYB0 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC31.52■■■□□ 2.64
FRMPD1Q5SYB0 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
FRMPD1Q5SYB0 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
FRMPD1Q5SYB0 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
FRMPD1Q5SYB0 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC31.52■■■□□ 2.64
FRMPD1Q5SYB0 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
FRMPD1Q5SYB0 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
FRMPD1Q5SYB0 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
FRMPD1Q5SYB0 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC31.51■■■□□ 2.64
FRMPD1Q5SYB0 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC31.51■■■□□ 2.64
FRMPD1Q5SYB0 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.51■■■□□ 2.64
FRMPD1Q5SYB0 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.51■■■□□ 2.64
FRMPD1Q5SYB0 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
FRMPD1Q5SYB0 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC31.51■■■□□ 2.64
FRMPD1Q5SYB0 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC31.51■■■□□ 2.63
FRMPD1Q5SYB0 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC31.51■■■□□ 2.63
FRMPD1Q5SYB0 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
FRMPD1Q5SYB0 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
FRMPD1Q5SYB0 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC31.51■■■□□ 2.63
FRMPD1Q5SYB0 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC31.51■■■□□ 2.63
FRMPD1Q5SYB0 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
FRMPD1Q5SYB0 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
FRMPD1Q5SYB0 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms