Protein–RNA interactions for Protein: Q5JTW2

CEP78, Centrosomal protein of 78 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP78Q5JTW2 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CEP78Q5JTW2 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CEP78Q5JTW2 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CEP78Q5JTW2 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CEP78Q5JTW2 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CEP78Q5JTW2 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CEP78Q5JTW2 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CEP78Q5JTW2 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CEP78Q5JTW2 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CEP78Q5JTW2 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CEP78Q5JTW2 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CEP78Q5JTW2 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CEP78Q5JTW2 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CEP78Q5JTW2 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CEP78Q5JTW2 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CEP78Q5JTW2 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CEP78Q5JTW2 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CEP78Q5JTW2 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CEP78Q5JTW2 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CEP78Q5JTW2 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CEP78Q5JTW2 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CEP78Q5JTW2 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CEP78Q5JTW2 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
CEP78Q5JTW2 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CEP78Q5JTW2 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CEP78Q5JTW2 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CEP78Q5JTW2 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CEP78Q5JTW2 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CEP78Q5JTW2 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CEP78Q5JTW2 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CEP78Q5JTW2 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CEP78Q5JTW2 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CEP78Q5JTW2 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CEP78Q5JTW2 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CEP78Q5JTW2 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CEP78Q5JTW2 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CEP78Q5JTW2 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CEP78Q5JTW2 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CEP78Q5JTW2 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CEP78Q5JTW2 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CEP78Q5JTW2 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CEP78Q5JTW2 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CEP78Q5JTW2 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CEP78Q5JTW2 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CEP78Q5JTW2 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CEP78Q5JTW2 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CEP78Q5JTW2 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
CEP78Q5JTW2 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
CEP78Q5JTW2 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CEP78Q5JTW2 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CEP78Q5JTW2 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CEP78Q5JTW2 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CEP78Q5JTW2 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CEP78Q5JTW2 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CEP78Q5JTW2 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CEP78Q5JTW2 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CEP78Q5JTW2 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CEP78Q5JTW2 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CEP78Q5JTW2 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
CEP78Q5JTW2 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CEP78Q5JTW2 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CEP78Q5JTW2 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
CEP78Q5JTW2 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CEP78Q5JTW2 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CEP78Q5JTW2 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CEP78Q5JTW2 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CEP78Q5JTW2 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CEP78Q5JTW2 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CEP78Q5JTW2 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CEP78Q5JTW2 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CEP78Q5JTW2 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CEP78Q5JTW2 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CEP78Q5JTW2 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CEP78Q5JTW2 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CEP78Q5JTW2 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CEP78Q5JTW2 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CEP78Q5JTW2 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
CEP78Q5JTW2 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CEP78Q5JTW2 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CEP78Q5JTW2 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
CEP78Q5JTW2 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CEP78Q5JTW2 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CEP78Q5JTW2 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CEP78Q5JTW2 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CEP78Q5JTW2 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CEP78Q5JTW2 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CEP78Q5JTW2 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CEP78Q5JTW2 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CEP78Q5JTW2 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CEP78Q5JTW2 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CEP78Q5JTW2 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CEP78Q5JTW2 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
CEP78Q5JTW2 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
CEP78Q5JTW2 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CEP78Q5JTW2 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CEP78Q5JTW2 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CEP78Q5JTW2 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CEP78Q5JTW2 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CEP78Q5JTW2 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CEP78Q5JTW2 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.8 ms