Protein–RNA interactions for Protein: Q58FF7

HSP90AB3P, Putative heat shock protein HSP 90-beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 597 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSP90AB3PQ58FF7 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
HSP90AB3PQ58FF7 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
HSP90AB3PQ58FF7 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
HSP90AB3PQ58FF7 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
HSP90AB3PQ58FF7 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
HSP90AB3PQ58FF7 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
HSP90AB3PQ58FF7 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
HSP90AB3PQ58FF7 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
HSP90AB3PQ58FF7 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
HSP90AB3PQ58FF7 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
HSP90AB3PQ58FF7 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
HSP90AB3PQ58FF7 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
HSP90AB3PQ58FF7 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
HSP90AB3PQ58FF7 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
HSP90AB3PQ58FF7 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
HSP90AB3PQ58FF7 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
HSP90AB3PQ58FF7 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
HSP90AB3PQ58FF7 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
HSP90AB3PQ58FF7 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
HSP90AB3PQ58FF7 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
HSP90AB3PQ58FF7 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
HSP90AB3PQ58FF7 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
HSP90AB3PQ58FF7 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
HSP90AB3PQ58FF7 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
HSP90AB3PQ58FF7 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
HSP90AB3PQ58FF7 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
HSP90AB3PQ58FF7 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
HSP90AB3PQ58FF7 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
HSP90AB3PQ58FF7 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
HSP90AB3PQ58FF7 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
HSP90AB3PQ58FF7 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
HSP90AB3PQ58FF7 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
HSP90AB3PQ58FF7 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
HSP90AB3PQ58FF7 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
HSP90AB3PQ58FF7 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
HSP90AB3PQ58FF7 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
HSP90AB3PQ58FF7 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
HSP90AB3PQ58FF7 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
HSP90AB3PQ58FF7 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
HSP90AB3PQ58FF7 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
HSP90AB3PQ58FF7 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
HSP90AB3PQ58FF7 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
HSP90AB3PQ58FF7 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
HSP90AB3PQ58FF7 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
HSP90AB3PQ58FF7 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
HSP90AB3PQ58FF7 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
HSP90AB3PQ58FF7 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
HSP90AB3PQ58FF7 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
HSP90AB3PQ58FF7 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
HSP90AB3PQ58FF7 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
HSP90AB3PQ58FF7 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
HSP90AB3PQ58FF7 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
HSP90AB3PQ58FF7 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
HSP90AB3PQ58FF7 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
HSP90AB3PQ58FF7 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
HSP90AB3PQ58FF7 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
HSP90AB3PQ58FF7 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
HSP90AB3PQ58FF7 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
HSP90AB3PQ58FF7 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
HSP90AB3PQ58FF7 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
HSP90AB3PQ58FF7 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
HSP90AB3PQ58FF7 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
HSP90AB3PQ58FF7 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
HSP90AB3PQ58FF7 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
HSP90AB3PQ58FF7 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
HSP90AB3PQ58FF7 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
HSP90AB3PQ58FF7 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
HSP90AB3PQ58FF7 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
HSP90AB3PQ58FF7 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
HSP90AB3PQ58FF7 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
HSP90AB3PQ58FF7 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
HSP90AB3PQ58FF7 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
HSP90AB3PQ58FF7 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
HSP90AB3PQ58FF7 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
HSP90AB3PQ58FF7 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
HSP90AB3PQ58FF7 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
HSP90AB3PQ58FF7 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
HSP90AB3PQ58FF7 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
HSP90AB3PQ58FF7 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
HSP90AB3PQ58FF7 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
HSP90AB3PQ58FF7 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
HSP90AB3PQ58FF7 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
HSP90AB3PQ58FF7 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
HSP90AB3PQ58FF7 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
HSP90AB3PQ58FF7 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
HSP90AB3PQ58FF7 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
HSP90AB3PQ58FF7 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
HSP90AB3PQ58FF7 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
HSP90AB3PQ58FF7 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
HSP90AB3PQ58FF7 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
HSP90AB3PQ58FF7 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
HSP90AB3PQ58FF7 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
HSP90AB3PQ58FF7 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
HSP90AB3PQ58FF7 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
HSP90AB3PQ58FF7 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
HSP90AB3PQ58FF7 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
HSP90AB3PQ58FF7 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
HSP90AB3PQ58FF7 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
HSP90AB3PQ58FF7 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
HSP90AB3PQ58FF7 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms