Protein–RNA interactions for Protein: Q53S48

ALF, STON1-GTF2A1L readthrough, humanhuman

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALFQ53S48 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ALFQ53S48 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ALFQ53S48 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
ALFQ53S48 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
ALFQ53S48 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ALFQ53S48 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ALFQ53S48 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ALFQ53S48 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ALFQ53S48 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ALFQ53S48 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
ALFQ53S48 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ALFQ53S48 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ALFQ53S48 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
ALFQ53S48 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ALFQ53S48 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ALFQ53S48 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ALFQ53S48 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ALFQ53S48 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ALFQ53S48 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ALFQ53S48 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ALFQ53S48 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ALFQ53S48 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ALFQ53S48 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ALFQ53S48 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ALFQ53S48 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ALFQ53S48 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ALFQ53S48 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ALFQ53S48 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ALFQ53S48 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ALFQ53S48 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ALFQ53S48 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ALFQ53S48 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ALFQ53S48 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ALFQ53S48 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ALFQ53S48 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ALFQ53S48 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ALFQ53S48 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ALFQ53S48 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ALFQ53S48 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ALFQ53S48 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ALFQ53S48 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ALFQ53S48 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
ALFQ53S48 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ALFQ53S48 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ALFQ53S48 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ALFQ53S48 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ALFQ53S48 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ALFQ53S48 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ALFQ53S48 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ALFQ53S48 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
ALFQ53S48 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ALFQ53S48 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ALFQ53S48 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ALFQ53S48 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ALFQ53S48 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ALFQ53S48 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ALFQ53S48 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ALFQ53S48 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ALFQ53S48 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ALFQ53S48 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ALFQ53S48 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ALFQ53S48 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ALFQ53S48 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ALFQ53S48 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ALFQ53S48 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ALFQ53S48 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ALFQ53S48 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ALFQ53S48 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ALFQ53S48 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ALFQ53S48 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ALFQ53S48 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ALFQ53S48 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ALFQ53S48 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ALFQ53S48 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ALFQ53S48 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ALFQ53S48 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ALFQ53S48 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ALFQ53S48 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ALFQ53S48 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ALFQ53S48 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ALFQ53S48 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ALFQ53S48 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ALFQ53S48 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ALFQ53S48 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ALFQ53S48 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ALFQ53S48 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ALFQ53S48 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ALFQ53S48 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ALFQ53S48 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ALFQ53S48 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ALFQ53S48 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ALFQ53S48 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ALFQ53S48 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ALFQ53S48 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ALFQ53S48 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ALFQ53S48 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ALFQ53S48 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ALFQ53S48 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ALFQ53S48 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ALFQ53S48 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms