Protein–RNA interactions for Protein: Q53GT1

KLHL22, Kelch-like protein 22, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL22Q53GT1 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KLHL22Q53GT1 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
KLHL22Q53GT1 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KLHL22Q53GT1 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
KLHL22Q53GT1 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KLHL22Q53GT1 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KLHL22Q53GT1 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KLHL22Q53GT1 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
KLHL22Q53GT1 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
KLHL22Q53GT1 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KLHL22Q53GT1 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KLHL22Q53GT1 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
KLHL22Q53GT1 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
KLHL22Q53GT1 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
KLHL22Q53GT1 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KLHL22Q53GT1 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KLHL22Q53GT1 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
KLHL22Q53GT1 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KLHL22Q53GT1 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
KLHL22Q53GT1 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KLHL22Q53GT1 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KLHL22Q53GT1 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
KLHL22Q53GT1 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
KLHL22Q53GT1 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
KLHL22Q53GT1 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
KLHL22Q53GT1 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
KLHL22Q53GT1 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
KLHL22Q53GT1 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
KLHL22Q53GT1 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
KLHL22Q53GT1 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
KLHL22Q53GT1 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
KLHL22Q53GT1 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
KLHL22Q53GT1 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
KLHL22Q53GT1 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
KLHL22Q53GT1 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
KLHL22Q53GT1 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
KLHL22Q53GT1 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
KLHL22Q53GT1 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
KLHL22Q53GT1 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
KLHL22Q53GT1 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
KLHL22Q53GT1 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
KLHL22Q53GT1 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
KLHL22Q53GT1 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
KLHL22Q53GT1 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
KLHL22Q53GT1 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
KLHL22Q53GT1 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
KLHL22Q53GT1 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
KLHL22Q53GT1 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
KLHL22Q53GT1 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
KLHL22Q53GT1 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
KLHL22Q53GT1 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
KLHL22Q53GT1 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
KLHL22Q53GT1 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
KLHL22Q53GT1 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
KLHL22Q53GT1 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
KLHL22Q53GT1 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
KLHL22Q53GT1 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
KLHL22Q53GT1 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
KLHL22Q53GT1 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
KLHL22Q53GT1 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
KLHL22Q53GT1 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
KLHL22Q53GT1 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
KLHL22Q53GT1 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
KLHL22Q53GT1 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
KLHL22Q53GT1 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
KLHL22Q53GT1 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
KLHL22Q53GT1 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
KLHL22Q53GT1 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
KLHL22Q53GT1 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
KLHL22Q53GT1 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
KLHL22Q53GT1 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
KLHL22Q53GT1 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
KLHL22Q53GT1 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
KLHL22Q53GT1 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
KLHL22Q53GT1 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
KLHL22Q53GT1 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
KLHL22Q53GT1 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
KLHL22Q53GT1 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
KLHL22Q53GT1 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
KLHL22Q53GT1 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
KLHL22Q53GT1 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
KLHL22Q53GT1 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
KLHL22Q53GT1 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
KLHL22Q53GT1 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
KLHL22Q53GT1 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
KLHL22Q53GT1 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
KLHL22Q53GT1 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
KLHL22Q53GT1 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
KLHL22Q53GT1 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
KLHL22Q53GT1 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
KLHL22Q53GT1 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
KLHL22Q53GT1 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
KLHL22Q53GT1 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
KLHL22Q53GT1 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
KLHL22Q53GT1 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
KLHL22Q53GT1 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
KLHL22Q53GT1 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
KLHL22Q53GT1 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
KLHL22Q53GT1 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
KLHL22Q53GT1 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.6 ms