Protein–RNA interactions for Protein: Q52LW3

ARHGAP29, Rho GTPase-activating protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 1,261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGAP29Q52LW3 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ARHGAP29Q52LW3 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ARHGAP29Q52LW3 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ARHGAP29Q52LW3 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ARHGAP29Q52LW3 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ARHGAP29Q52LW3 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ARHGAP29Q52LW3 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ARHGAP29Q52LW3 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ARHGAP29Q52LW3 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ARHGAP29Q52LW3 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ARHGAP29Q52LW3 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
ARHGAP29Q52LW3 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ARHGAP29Q52LW3 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ARHGAP29Q52LW3 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ARHGAP29Q52LW3 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
ARHGAP29Q52LW3 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ARHGAP29Q52LW3 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ARHGAP29Q52LW3 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ARHGAP29Q52LW3 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ARHGAP29Q52LW3 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ARHGAP29Q52LW3 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ARHGAP29Q52LW3 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
ARHGAP29Q52LW3 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ARHGAP29Q52LW3 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ARHGAP29Q52LW3 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ARHGAP29Q52LW3 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ARHGAP29Q52LW3 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ARHGAP29Q52LW3 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ARHGAP29Q52LW3 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ARHGAP29Q52LW3 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ARHGAP29Q52LW3 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ARHGAP29Q52LW3 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ARHGAP29Q52LW3 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ARHGAP29Q52LW3 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ARHGAP29Q52LW3 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ARHGAP29Q52LW3 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ARHGAP29Q52LW3 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ARHGAP29Q52LW3 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ARHGAP29Q52LW3 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ARHGAP29Q52LW3 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ARHGAP29Q52LW3 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ARHGAP29Q52LW3 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ARHGAP29Q52LW3 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
ARHGAP29Q52LW3 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ARHGAP29Q52LW3 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
ARHGAP29Q52LW3 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ARHGAP29Q52LW3 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ARHGAP29Q52LW3 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ARHGAP29Q52LW3 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ARHGAP29Q52LW3 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ARHGAP29Q52LW3 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ARHGAP29Q52LW3 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ARHGAP29Q52LW3 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ARHGAP29Q52LW3 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ARHGAP29Q52LW3 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ARHGAP29Q52LW3 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ARHGAP29Q52LW3 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ARHGAP29Q52LW3 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ARHGAP29Q52LW3 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ARHGAP29Q52LW3 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ARHGAP29Q52LW3 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ARHGAP29Q52LW3 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ARHGAP29Q52LW3 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ARHGAP29Q52LW3 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ARHGAP29Q52LW3 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ARHGAP29Q52LW3 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ARHGAP29Q52LW3 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ARHGAP29Q52LW3 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ARHGAP29Q52LW3 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
ARHGAP29Q52LW3 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ARHGAP29Q52LW3 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ARHGAP29Q52LW3 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
ARHGAP29Q52LW3 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ARHGAP29Q52LW3 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ARHGAP29Q52LW3 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ARHGAP29Q52LW3 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ARHGAP29Q52LW3 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ARHGAP29Q52LW3 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ARHGAP29Q52LW3 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ARHGAP29Q52LW3 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
ARHGAP29Q52LW3 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ARHGAP29Q52LW3 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
ARHGAP29Q52LW3 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ARHGAP29Q52LW3 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ARHGAP29Q52LW3 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ARHGAP29Q52LW3 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ARHGAP29Q52LW3 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ARHGAP29Q52LW3 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ARHGAP29Q52LW3 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ARHGAP29Q52LW3 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ARHGAP29Q52LW3 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ARHGAP29Q52LW3 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
ARHGAP29Q52LW3 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ARHGAP29Q52LW3 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ARHGAP29Q52LW3 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ARHGAP29Q52LW3 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ARHGAP29Q52LW3 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ARHGAP29Q52LW3 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ARHGAP29Q52LW3 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ARHGAP29Q52LW3 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms