Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZIN3

TMEM259, Membralin, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM259Q4ZIN3 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMEM259Q4ZIN3 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMEM259Q4ZIN3 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMEM259Q4ZIN3 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMEM259Q4ZIN3 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMEM259Q4ZIN3 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TMEM259Q4ZIN3 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TMEM259Q4ZIN3 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TMEM259Q4ZIN3 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TMEM259Q4ZIN3 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TMEM259Q4ZIN3 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TMEM259Q4ZIN3 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TMEM259Q4ZIN3 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TMEM259Q4ZIN3 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TMEM259Q4ZIN3 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TMEM259Q4ZIN3 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TMEM259Q4ZIN3 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TMEM259Q4ZIN3 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
TMEM259Q4ZIN3 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TMEM259Q4ZIN3 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TMEM259Q4ZIN3 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TMEM259Q4ZIN3 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TMEM259Q4ZIN3 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TMEM259Q4ZIN3 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TMEM259Q4ZIN3 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TMEM259Q4ZIN3 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
TMEM259Q4ZIN3 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TMEM259Q4ZIN3 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TMEM259Q4ZIN3 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TMEM259Q4ZIN3 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
TMEM259Q4ZIN3 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TMEM259Q4ZIN3 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TMEM259Q4ZIN3 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
TMEM259Q4ZIN3 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
TMEM259Q4ZIN3 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
TMEM259Q4ZIN3 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TMEM259Q4ZIN3 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TMEM259Q4ZIN3 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TMEM259Q4ZIN3 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TMEM259Q4ZIN3 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TMEM259Q4ZIN3 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TMEM259Q4ZIN3 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TMEM259Q4ZIN3 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TMEM259Q4ZIN3 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TMEM259Q4ZIN3 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TMEM259Q4ZIN3 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TMEM259Q4ZIN3 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TMEM259Q4ZIN3 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TMEM259Q4ZIN3 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
TMEM259Q4ZIN3 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TMEM259Q4ZIN3 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TMEM259Q4ZIN3 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TMEM259Q4ZIN3 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TMEM259Q4ZIN3 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TMEM259Q4ZIN3 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TMEM259Q4ZIN3 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TMEM259Q4ZIN3 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TMEM259Q4ZIN3 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TMEM259Q4ZIN3 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TMEM259Q4ZIN3 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TMEM259Q4ZIN3 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TMEM259Q4ZIN3 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TMEM259Q4ZIN3 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TMEM259Q4ZIN3 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TMEM259Q4ZIN3 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TMEM259Q4ZIN3 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TMEM259Q4ZIN3 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
TMEM259Q4ZIN3 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TMEM259Q4ZIN3 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TMEM259Q4ZIN3 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TMEM259Q4ZIN3 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TMEM259Q4ZIN3 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TMEM259Q4ZIN3 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TMEM259Q4ZIN3 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TMEM259Q4ZIN3 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TMEM259Q4ZIN3 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TMEM259Q4ZIN3 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TMEM259Q4ZIN3 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TMEM259Q4ZIN3 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TMEM259Q4ZIN3 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TMEM259Q4ZIN3 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TMEM259Q4ZIN3 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
TMEM259Q4ZIN3 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
TMEM259Q4ZIN3 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
TMEM259Q4ZIN3 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TMEM259Q4ZIN3 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TMEM259Q4ZIN3 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
TMEM259Q4ZIN3 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TMEM259Q4ZIN3 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TMEM259Q4ZIN3 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TMEM259Q4ZIN3 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TMEM259Q4ZIN3 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TMEM259Q4ZIN3 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TMEM259Q4ZIN3 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TMEM259Q4ZIN3 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TMEM259Q4ZIN3 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TMEM259Q4ZIN3 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TMEM259Q4ZIN3 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TMEM259Q4ZIN3 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TMEM259Q4ZIN3 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms