Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0W2

DUSP28, Dual specificity phosphatase 28, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP28Q4G0W2 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DUSP28Q4G0W2 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DUSP28Q4G0W2 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
DUSP28Q4G0W2 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DUSP28Q4G0W2 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DUSP28Q4G0W2 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DUSP28Q4G0W2 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DUSP28Q4G0W2 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DUSP28Q4G0W2 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
DUSP28Q4G0W2 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DUSP28Q4G0W2 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DUSP28Q4G0W2 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DUSP28Q4G0W2 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DUSP28Q4G0W2 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DUSP28Q4G0W2 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
DUSP28Q4G0W2 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
DUSP28Q4G0W2 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
DUSP28Q4G0W2 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
DUSP28Q4G0W2 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DUSP28Q4G0W2 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
DUSP28Q4G0W2 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
DUSP28Q4G0W2 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
DUSP28Q4G0W2 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DUSP28Q4G0W2 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DUSP28Q4G0W2 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DUSP28Q4G0W2 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DUSP28Q4G0W2 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DUSP28Q4G0W2 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DUSP28Q4G0W2 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DUSP28Q4G0W2 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DUSP28Q4G0W2 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DUSP28Q4G0W2 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DUSP28Q4G0W2 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DUSP28Q4G0W2 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
DUSP28Q4G0W2 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DUSP28Q4G0W2 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DUSP28Q4G0W2 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DUSP28Q4G0W2 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DUSP28Q4G0W2 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
DUSP28Q4G0W2 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DUSP28Q4G0W2 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DUSP28Q4G0W2 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DUSP28Q4G0W2 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DUSP28Q4G0W2 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DUSP28Q4G0W2 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DUSP28Q4G0W2 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DUSP28Q4G0W2 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DUSP28Q4G0W2 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DUSP28Q4G0W2 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DUSP28Q4G0W2 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DUSP28Q4G0W2 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DUSP28Q4G0W2 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DUSP28Q4G0W2 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DUSP28Q4G0W2 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DUSP28Q4G0W2 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DUSP28Q4G0W2 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DUSP28Q4G0W2 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DUSP28Q4G0W2 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DUSP28Q4G0W2 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DUSP28Q4G0W2 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DUSP28Q4G0W2 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DUSP28Q4G0W2 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DUSP28Q4G0W2 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
DUSP28Q4G0W2 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DUSP28Q4G0W2 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DUSP28Q4G0W2 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DUSP28Q4G0W2 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DUSP28Q4G0W2 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DUSP28Q4G0W2 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DUSP28Q4G0W2 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DUSP28Q4G0W2 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DUSP28Q4G0W2 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DUSP28Q4G0W2 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DUSP28Q4G0W2 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DUSP28Q4G0W2 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DUSP28Q4G0W2 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
DUSP28Q4G0W2 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DUSP28Q4G0W2 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DUSP28Q4G0W2 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DUSP28Q4G0W2 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DUSP28Q4G0W2 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DUSP28Q4G0W2 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DUSP28Q4G0W2 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DUSP28Q4G0W2 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DUSP28Q4G0W2 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DUSP28Q4G0W2 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DUSP28Q4G0W2 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DUSP28Q4G0W2 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DUSP28Q4G0W2 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DUSP28Q4G0W2 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DUSP28Q4G0W2 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DUSP28Q4G0W2 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
DUSP28Q4G0W2 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DUSP28Q4G0W2 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DUSP28Q4G0W2 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DUSP28Q4G0W2 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DUSP28Q4G0W2 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
DUSP28Q4G0W2 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DUSP28Q4G0W2 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DUSP28Q4G0W2 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.2 ms