Protein–RNA interactions for Protein: Q2NKQ1

SGSM1, Small G protein signaling modulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGSM1Q2NKQ1 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SGSM1Q2NKQ1 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SGSM1Q2NKQ1 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SGSM1Q2NKQ1 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SGSM1Q2NKQ1 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SGSM1Q2NKQ1 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SGSM1Q2NKQ1 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SGSM1Q2NKQ1 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SGSM1Q2NKQ1 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SGSM1Q2NKQ1 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SGSM1Q2NKQ1 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SGSM1Q2NKQ1 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SGSM1Q2NKQ1 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SGSM1Q2NKQ1 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SGSM1Q2NKQ1 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SGSM1Q2NKQ1 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SGSM1Q2NKQ1 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SGSM1Q2NKQ1 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SGSM1Q2NKQ1 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SGSM1Q2NKQ1 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SGSM1Q2NKQ1 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SGSM1Q2NKQ1 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SGSM1Q2NKQ1 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SGSM1Q2NKQ1 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SGSM1Q2NKQ1 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SGSM1Q2NKQ1 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SGSM1Q2NKQ1 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SGSM1Q2NKQ1 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SGSM1Q2NKQ1 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SGSM1Q2NKQ1 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SGSM1Q2NKQ1 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SGSM1Q2NKQ1 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SGSM1Q2NKQ1 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SGSM1Q2NKQ1 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SGSM1Q2NKQ1 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SGSM1Q2NKQ1 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SGSM1Q2NKQ1 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SGSM1Q2NKQ1 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SGSM1Q2NKQ1 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SGSM1Q2NKQ1 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SGSM1Q2NKQ1 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SGSM1Q2NKQ1 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SGSM1Q2NKQ1 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SGSM1Q2NKQ1 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SGSM1Q2NKQ1 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SGSM1Q2NKQ1 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SGSM1Q2NKQ1 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SGSM1Q2NKQ1 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SGSM1Q2NKQ1 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SGSM1Q2NKQ1 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SGSM1Q2NKQ1 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SGSM1Q2NKQ1 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SGSM1Q2NKQ1 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SGSM1Q2NKQ1 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SGSM1Q2NKQ1 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SGSM1Q2NKQ1 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SGSM1Q2NKQ1 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SGSM1Q2NKQ1 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SGSM1Q2NKQ1 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SGSM1Q2NKQ1 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SGSM1Q2NKQ1 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SGSM1Q2NKQ1 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SGSM1Q2NKQ1 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SGSM1Q2NKQ1 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SGSM1Q2NKQ1 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SGSM1Q2NKQ1 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SGSM1Q2NKQ1 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SGSM1Q2NKQ1 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SGSM1Q2NKQ1 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SGSM1Q2NKQ1 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SGSM1Q2NKQ1 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SGSM1Q2NKQ1 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SGSM1Q2NKQ1 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SGSM1Q2NKQ1 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SGSM1Q2NKQ1 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SGSM1Q2NKQ1 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SGSM1Q2NKQ1 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SGSM1Q2NKQ1 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SGSM1Q2NKQ1 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SGSM1Q2NKQ1 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SGSM1Q2NKQ1 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SGSM1Q2NKQ1 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SGSM1Q2NKQ1 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SGSM1Q2NKQ1 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SGSM1Q2NKQ1 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SGSM1Q2NKQ1 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SGSM1Q2NKQ1 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SGSM1Q2NKQ1 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SGSM1Q2NKQ1 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SGSM1Q2NKQ1 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SGSM1Q2NKQ1 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SGSM1Q2NKQ1 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SGSM1Q2NKQ1 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SGSM1Q2NKQ1 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SGSM1Q2NKQ1 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SGSM1Q2NKQ1 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SGSM1Q2NKQ1 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SGSM1Q2NKQ1 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SGSM1Q2NKQ1 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SGSM1Q2NKQ1 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
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