Protein–RNA interactions for Protein: Q16878

CDO1, Cysteine dioxygenase type 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDO1Q16878 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CDO1Q16878 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CDO1Q16878 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CDO1Q16878 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CDO1Q16878 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CDO1Q16878 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CDO1Q16878 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CDO1Q16878 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CDO1Q16878 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CDO1Q16878 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CDO1Q16878 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CDO1Q16878 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CDO1Q16878 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CDO1Q16878 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CDO1Q16878 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CDO1Q16878 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CDO1Q16878 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CDO1Q16878 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CDO1Q16878 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CDO1Q16878 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CDO1Q16878 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CDO1Q16878 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CDO1Q16878 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CDO1Q16878 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CDO1Q16878 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CDO1Q16878 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CDO1Q16878 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CDO1Q16878 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CDO1Q16878 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CDO1Q16878 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CDO1Q16878 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CDO1Q16878 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CDO1Q16878 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CDO1Q16878 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CDO1Q16878 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CDO1Q16878 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CDO1Q16878 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CDO1Q16878 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CDO1Q16878 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CDO1Q16878 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CDO1Q16878 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CDO1Q16878 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CDO1Q16878 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CDO1Q16878 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CDO1Q16878 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CDO1Q16878 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CDO1Q16878 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CDO1Q16878 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CDO1Q16878 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CDO1Q16878 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CDO1Q16878 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CDO1Q16878 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CDO1Q16878 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CDO1Q16878 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CDO1Q16878 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CDO1Q16878 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CDO1Q16878 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CDO1Q16878 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CDO1Q16878 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CDO1Q16878 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CDO1Q16878 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CDO1Q16878 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CDO1Q16878 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CDO1Q16878 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CDO1Q16878 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CDO1Q16878 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CDO1Q16878 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CDO1Q16878 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CDO1Q16878 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CDO1Q16878 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CDO1Q16878 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CDO1Q16878 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CDO1Q16878 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CDO1Q16878 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CDO1Q16878 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDO1Q16878 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDO1Q16878 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDO1Q16878 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDO1Q16878 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDO1Q16878 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDO1Q16878 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CDO1Q16878 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDO1Q16878 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDO1Q16878 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDO1Q16878 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDO1Q16878 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDO1Q16878 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDO1Q16878 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDO1Q16878 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDO1Q16878 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDO1Q16878 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDO1Q16878 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDO1Q16878 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDO1Q16878 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDO1Q16878 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDO1Q16878 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CDO1Q16878 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CDO1Q16878 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDO1Q16878 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDO1Q16878 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
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