Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNF239Q16600 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNF239Q16600 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNF239Q16600 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNF239Q16600 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNF239Q16600 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNF239Q16600 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNF239Q16600 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNF239Q16600 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNF239Q16600 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNF239Q16600 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNF239Q16600 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNF239Q16600 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNF239Q16600 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZNF239Q16600 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZNF239Q16600 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZNF239Q16600 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZNF239Q16600 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZNF239Q16600 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZNF239Q16600 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZNF239Q16600 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZNF239Q16600 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZNF239Q16600 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZNF239Q16600 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
ZNF239Q16600 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZNF239Q16600 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZNF239Q16600 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZNF239Q16600 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZNF239Q16600 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZNF239Q16600 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZNF239Q16600 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZNF239Q16600 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZNF239Q16600 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZNF239Q16600 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZNF239Q16600 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZNF239Q16600 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZNF239Q16600 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
ZNF239Q16600 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZNF239Q16600 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZNF239Q16600 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZNF239Q16600 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZNF239Q16600 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZNF239Q16600 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZNF239Q16600 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZNF239Q16600 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZNF239Q16600 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZNF239Q16600 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZNF239Q16600 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZNF239Q16600 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZNF239Q16600 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZNF239Q16600 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZNF239Q16600 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZNF239Q16600 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
ZNF239Q16600 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZNF239Q16600 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZNF239Q16600 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZNF239Q16600 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZNF239Q16600 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZNF239Q16600 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZNF239Q16600 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZNF239Q16600 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZNF239Q16600 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZNF239Q16600 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZNF239Q16600 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZNF239Q16600 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ZNF239Q16600 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ZNF239Q16600 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ZNF239Q16600 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ZNF239Q16600 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ZNF239Q16600 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ZNF239Q16600 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
ZNF239Q16600 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ZNF239Q16600 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ZNF239Q16600 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ZNF239Q16600 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ZNF239Q16600 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ZNF239Q16600 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ZNF239Q16600 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ZNF239Q16600 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ZNF239Q16600 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ZNF239Q16600 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ZNF239Q16600 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ZNF239Q16600 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ZNF239Q16600 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ZNF239Q16600 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ZNF239Q16600 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ZNF239Q16600 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZNF239Q16600 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZNF239Q16600 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZNF239Q16600 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZNF239Q16600 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZNF239Q16600 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZNF239Q16600 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZNF239Q16600 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
ZNF239Q16600 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZNF239Q16600 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZNF239Q16600 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
ZNF239Q16600 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
ZNF239Q16600 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
ZNF239Q16600 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
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