Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
USF2Q15853 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
USF2Q15853 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
USF2Q15853 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
USF2Q15853 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
USF2Q15853 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
USF2Q15853 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
USF2Q15853 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
USF2Q15853 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
USF2Q15853 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
USF2Q15853 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
USF2Q15853 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
USF2Q15853 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
USF2Q15853 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
USF2Q15853 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
USF2Q15853 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
USF2Q15853 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
USF2Q15853 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
USF2Q15853 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
USF2Q15853 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
USF2Q15853 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
USF2Q15853 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
USF2Q15853 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
USF2Q15853 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
USF2Q15853 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
USF2Q15853 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
USF2Q15853 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
USF2Q15853 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
USF2Q15853 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
USF2Q15853 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
USF2Q15853 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
USF2Q15853 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
USF2Q15853 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
USF2Q15853 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
USF2Q15853 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
USF2Q15853 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
USF2Q15853 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
USF2Q15853 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
USF2Q15853 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
USF2Q15853 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
USF2Q15853 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
USF2Q15853 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
USF2Q15853 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
USF2Q15853 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
USF2Q15853 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
USF2Q15853 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
USF2Q15853 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
USF2Q15853 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
USF2Q15853 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
USF2Q15853 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
USF2Q15853 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
USF2Q15853 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
USF2Q15853 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
USF2Q15853 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
USF2Q15853 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
USF2Q15853 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
USF2Q15853 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
USF2Q15853 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
USF2Q15853 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
USF2Q15853 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
USF2Q15853 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
USF2Q15853 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
USF2Q15853 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
USF2Q15853 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
USF2Q15853 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
USF2Q15853 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
USF2Q15853 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
USF2Q15853 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
USF2Q15853 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
USF2Q15853 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
USF2Q15853 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
USF2Q15853 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
USF2Q15853 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
USF2Q15853 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
USF2Q15853 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
USF2Q15853 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
USF2Q15853 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
USF2Q15853 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
USF2Q15853 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
USF2Q15853 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
USF2Q15853 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
USF2Q15853 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
USF2Q15853 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
USF2Q15853 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
USF2Q15853 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
USF2Q15853 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
USF2Q15853 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
USF2Q15853 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
USF2Q15853 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
USF2Q15853 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
USF2Q15853 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
USF2Q15853 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
USF2Q15853 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
USF2Q15853 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
USF2Q15853 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
USF2Q15853 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
USF2Q15853 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
USF2Q15853 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
USF2Q15853 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
USF2Q15853 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms