Protein–RNA interactions for Protein: Q15649

ZNHIT3, Zinc finger HIT domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 155 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNHIT3Q15649 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
ZNHIT3Q15649 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC19.39■□□□□ 0.7
ZNHIT3Q15649 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ZNHIT3Q15649 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ZNHIT3Q15649 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ZNHIT3Q15649 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ZNHIT3Q15649 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ZNHIT3Q15649 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
ZNHIT3Q15649 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
ZNHIT3Q15649 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
ZNHIT3Q15649 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
ZNHIT3Q15649 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ZNHIT3Q15649 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ZNHIT3Q15649 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ZNHIT3Q15649 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
ZNHIT3Q15649 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ZNHIT3Q15649 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ZNHIT3Q15649 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
ZNHIT3Q15649 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
ZNHIT3Q15649 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ZNHIT3Q15649 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ZNHIT3Q15649 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ZNHIT3Q15649 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ZNHIT3Q15649 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ZNHIT3Q15649 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ZNHIT3Q15649 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ZNHIT3Q15649 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ZNHIT3Q15649 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ZNHIT3Q15649 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ZNHIT3Q15649 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ZNHIT3Q15649 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ZNHIT3Q15649 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ZNHIT3Q15649 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ZNHIT3Q15649 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ZNHIT3Q15649 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ZNHIT3Q15649 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ZNHIT3Q15649 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ZNHIT3Q15649 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ZNHIT3Q15649 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ZNHIT3Q15649 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ZNHIT3Q15649 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ZNHIT3Q15649 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ZNHIT3Q15649 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ZNHIT3Q15649 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ZNHIT3Q15649 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
ZNHIT3Q15649 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ZNHIT3Q15649 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ZNHIT3Q15649 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ZNHIT3Q15649 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ZNHIT3Q15649 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ZNHIT3Q15649 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ZNHIT3Q15649 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ZNHIT3Q15649 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ZNHIT3Q15649 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ZNHIT3Q15649 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ZNHIT3Q15649 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ZNHIT3Q15649 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ZNHIT3Q15649 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ZNHIT3Q15649 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ZNHIT3Q15649 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ZNHIT3Q15649 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ZNHIT3Q15649 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ZNHIT3Q15649 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ZNHIT3Q15649 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ZNHIT3Q15649 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
ZNHIT3Q15649 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ZNHIT3Q15649 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ZNHIT3Q15649 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ZNHIT3Q15649 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ZNHIT3Q15649 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ZNHIT3Q15649 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ZNHIT3Q15649 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ZNHIT3Q15649 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ZNHIT3Q15649 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ZNHIT3Q15649 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ZNHIT3Q15649 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ZNHIT3Q15649 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ZNHIT3Q15649 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ZNHIT3Q15649 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ZNHIT3Q15649 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ZNHIT3Q15649 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ZNHIT3Q15649 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
ZNHIT3Q15649 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ZNHIT3Q15649 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ZNHIT3Q15649 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ZNHIT3Q15649 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ZNHIT3Q15649 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ZNHIT3Q15649 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ZNHIT3Q15649 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ZNHIT3Q15649 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ZNHIT3Q15649 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ZNHIT3Q15649 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ZNHIT3Q15649 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ZNHIT3Q15649 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ZNHIT3Q15649 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ZNHIT3Q15649 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ZNHIT3Q15649 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ZNHIT3Q15649 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ZNHIT3Q15649 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ZNHIT3Q15649 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms