Protein–RNA interactions for Protein: Q15437

SEC23B, Protein transport protein Sec23B, humanhuman

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Length 767 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23BQ15437 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SEC23BQ15437 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SEC23BQ15437 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SEC23BQ15437 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SEC23BQ15437 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SEC23BQ15437 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SEC23BQ15437 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SEC23BQ15437 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SEC23BQ15437 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SEC23BQ15437 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SEC23BQ15437 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SEC23BQ15437 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SEC23BQ15437 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SEC23BQ15437 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SEC23BQ15437 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SEC23BQ15437 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SEC23BQ15437 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SEC23BQ15437 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SEC23BQ15437 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SEC23BQ15437 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SEC23BQ15437 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SEC23BQ15437 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SEC23BQ15437 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SEC23BQ15437 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SEC23BQ15437 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SEC23BQ15437 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SEC23BQ15437 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SEC23BQ15437 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SEC23BQ15437 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SEC23BQ15437 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SEC23BQ15437 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SEC23BQ15437 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SEC23BQ15437 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SEC23BQ15437 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SEC23BQ15437 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
SEC23BQ15437 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SEC23BQ15437 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SEC23BQ15437 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SEC23BQ15437 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SEC23BQ15437 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SEC23BQ15437 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SEC23BQ15437 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SEC23BQ15437 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
SEC23BQ15437 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SEC23BQ15437 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
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SEC23BQ15437 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SEC23BQ15437 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SEC23BQ15437 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SEC23BQ15437 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SEC23BQ15437 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SEC23BQ15437 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SEC23BQ15437 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SEC23BQ15437 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SEC23BQ15437 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SEC23BQ15437 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SEC23BQ15437 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SEC23BQ15437 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
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SEC23BQ15437 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SEC23BQ15437 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SEC23BQ15437 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SEC23BQ15437 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SEC23BQ15437 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
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SEC23BQ15437 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
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SEC23BQ15437 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
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SEC23BQ15437 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SEC23BQ15437 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SEC23BQ15437 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SEC23BQ15437 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SEC23BQ15437 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SEC23BQ15437 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SEC23BQ15437 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SEC23BQ15437 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SEC23BQ15437 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SEC23BQ15437 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SEC23BQ15437 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SEC23BQ15437 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SEC23BQ15437 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SEC23BQ15437 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SEC23BQ15437 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SEC23BQ15437 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SEC23BQ15437 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SEC23BQ15437 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
SEC23BQ15437 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SEC23BQ15437 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
SEC23BQ15437 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SEC23BQ15437 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SEC23BQ15437 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
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