Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SYCP1Q15431 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SYCP1Q15431 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SYCP1Q15431 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SYCP1Q15431 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SYCP1Q15431 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SYCP1Q15431 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SYCP1Q15431 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SYCP1Q15431 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SYCP1Q15431 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SYCP1Q15431 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SYCP1Q15431 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SYCP1Q15431 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SYCP1Q15431 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SYCP1Q15431 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.27
SYCP1Q15431 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SYCP1Q15431 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SYCP1Q15431 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SYCP1Q15431 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SYCP1Q15431 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SYCP1Q15431 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SYCP1Q15431 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SYCP1Q15431 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SYCP1Q15431 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SYCP1Q15431 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SYCP1Q15431 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SYCP1Q15431 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SYCP1Q15431 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SYCP1Q15431 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SYCP1Q15431 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SYCP1Q15431 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SYCP1Q15431 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SYCP1Q15431 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SYCP1Q15431 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SYCP1Q15431 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SYCP1Q15431 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SYCP1Q15431 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SYCP1Q15431 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SYCP1Q15431 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SYCP1Q15431 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SYCP1Q15431 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SYCP1Q15431 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SYCP1Q15431 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SYCP1Q15431 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SYCP1Q15431 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
SYCP1Q15431 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SYCP1Q15431 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SYCP1Q15431 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SYCP1Q15431 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SYCP1Q15431 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SYCP1Q15431 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SYCP1Q15431 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SYCP1Q15431 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SYCP1Q15431 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SYCP1Q15431 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SYCP1Q15431 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SYCP1Q15431 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SYCP1Q15431 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SYCP1Q15431 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SYCP1Q15431 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SYCP1Q15431 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SYCP1Q15431 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SYCP1Q15431 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SYCP1Q15431 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SYCP1Q15431 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SYCP1Q15431 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SYCP1Q15431 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYCP1Q15431 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYCP1Q15431 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYCP1Q15431 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYCP1Q15431 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYCP1Q15431 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYCP1Q15431 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYCP1Q15431 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYCP1Q15431 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYCP1Q15431 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYCP1Q15431 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYCP1Q15431 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYCP1Q15431 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYCP1Q15431 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYCP1Q15431 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYCP1Q15431 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYCP1Q15431 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYCP1Q15431 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYCP1Q15431 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYCP1Q15431 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYCP1Q15431 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYCP1Q15431 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYCP1Q15431 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYCP1Q15431 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYCP1Q15431 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYCP1Q15431 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYCP1Q15431 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYCP1Q15431 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYCP1Q15431 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYCP1Q15431 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYCP1Q15431 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SYCP1Q15431 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYCP1Q15431 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYCP1Q15431 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
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