Protein–RNA interactions for Protein: Q15413

RYR3, Ryanodine receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 4,870 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYR3Q15413 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
RYR3Q15413 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
RYR3Q15413 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
RYR3Q15413 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
RYR3Q15413 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
RYR3Q15413 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
RYR3Q15413 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC14.2□□□□□ -0.14
RYR3Q15413 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
RYR3Q15413 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
RYR3Q15413 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
RYR3Q15413 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
RYR3Q15413 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
RYR3Q15413 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
RYR3Q15413 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
RYR3Q15413 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
RYR3Q15413 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
RYR3Q15413 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
RYR3Q15413 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
RYR3Q15413 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
RYR3Q15413 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
RYR3Q15413 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
RYR3Q15413 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
RYR3Q15413 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
RYR3Q15413 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
RYR3Q15413 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
RYR3Q15413 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
RYR3Q15413 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
RYR3Q15413 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
RYR3Q15413 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
RYR3Q15413 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
RYR3Q15413 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
RYR3Q15413 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
RYR3Q15413 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
RYR3Q15413 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
RYR3Q15413 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
RYR3Q15413 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
RYR3Q15413 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
RYR3Q15413 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
RYR3Q15413 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
RYR3Q15413 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
RYR3Q15413 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
RYR3Q15413 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
RYR3Q15413 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
RYR3Q15413 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
RYR3Q15413 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
RYR3Q15413 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
RYR3Q15413 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
RYR3Q15413 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
RYR3Q15413 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
RYR3Q15413 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
RYR3Q15413 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
RYR3Q15413 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
RYR3Q15413 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
RYR3Q15413 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
RYR3Q15413 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
RYR3Q15413 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
RYR3Q15413 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
RYR3Q15413 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
RYR3Q15413 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
RYR3Q15413 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
RYR3Q15413 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
RYR3Q15413 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
RYR3Q15413 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.18□□□□□ -0.14
RYR3Q15413 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
RYR3Q15413 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
RYR3Q15413 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
RYR3Q15413 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
RYR3Q15413 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
RYR3Q15413 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
RYR3Q15413 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
RYR3Q15413 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC14.17□□□□□ -0.14
RYR3Q15413 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
RYR3Q15413 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
RYR3Q15413 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
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RYR3Q15413 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
RYR3Q15413 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
RYR3Q15413 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
RYR3Q15413 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
RYR3Q15413 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
RYR3Q15413 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
RYR3Q15413 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
RYR3Q15413 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
RYR3Q15413 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
RYR3Q15413 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC14.16□□□□□ -0.14
RYR3Q15413 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
RYR3Q15413 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
RYR3Q15413 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
RYR3Q15413 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
RYR3Q15413 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
RYR3Q15413 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
RYR3Q15413 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
RYR3Q15413 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
RYR3Q15413 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
RYR3Q15413 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
RYR3Q15413 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
RYR3Q15413 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
RYR3Q15413 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
RYR3Q15413 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
RYR3Q15413 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
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