Protein–RNA interactions for Protein: Q15397

PUM3, Pumilio homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM3Q15397 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PUM3Q15397 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PUM3Q15397 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
PUM3Q15397 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PUM3Q15397 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PUM3Q15397 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PUM3Q15397 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PUM3Q15397 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PUM3Q15397 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PUM3Q15397 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PUM3Q15397 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PUM3Q15397 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PUM3Q15397 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PUM3Q15397 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PUM3Q15397 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PUM3Q15397 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PUM3Q15397 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PUM3Q15397 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PUM3Q15397 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PUM3Q15397 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PUM3Q15397 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PUM3Q15397 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PUM3Q15397 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PUM3Q15397 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PUM3Q15397 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
PUM3Q15397 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PUM3Q15397 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PUM3Q15397 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PUM3Q15397 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PUM3Q15397 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
PUM3Q15397 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PUM3Q15397 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PUM3Q15397 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
PUM3Q15397 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
PUM3Q15397 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
PUM3Q15397 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
PUM3Q15397 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PUM3Q15397 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PUM3Q15397 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PUM3Q15397 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
PUM3Q15397 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PUM3Q15397 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PUM3Q15397 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PUM3Q15397 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PUM3Q15397 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PUM3Q15397 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PUM3Q15397 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PUM3Q15397 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
PUM3Q15397 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PUM3Q15397 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PUM3Q15397 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PUM3Q15397 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PUM3Q15397 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PUM3Q15397 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PUM3Q15397 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PUM3Q15397 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PUM3Q15397 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PUM3Q15397 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PUM3Q15397 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PUM3Q15397 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PUM3Q15397 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PUM3Q15397 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PUM3Q15397 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PUM3Q15397 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PUM3Q15397 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PUM3Q15397 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PUM3Q15397 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PUM3Q15397 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PUM3Q15397 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PUM3Q15397 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PUM3Q15397 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PUM3Q15397 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PUM3Q15397 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PUM3Q15397 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PUM3Q15397 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PUM3Q15397 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PUM3Q15397 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PUM3Q15397 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PUM3Q15397 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PUM3Q15397 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PUM3Q15397 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PUM3Q15397 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PUM3Q15397 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PUM3Q15397 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PUM3Q15397 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PUM3Q15397 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
PUM3Q15397 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PUM3Q15397 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
PUM3Q15397 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PUM3Q15397 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
PUM3Q15397 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PUM3Q15397 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PUM3Q15397 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PUM3Q15397 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PUM3Q15397 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PUM3Q15397 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PUM3Q15397 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PUM3Q15397 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PUM3Q15397 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PUM3Q15397 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms